稻属AA-基因组物种的重复序列研究
文献类型：学位论文
| 作者 | 张群洁 |
| 答辩日期 | 2014-05 |
| 授予单位 | 中国科学院大学 |
| 授予地点 | 北京 |
| 导师 | 高立志 |
| 关键词 | 稻属AA-基因组物种 全基因组测序 LTR逆转录转座子 SSRs 转座子-基因 |
| 学位专业 | 植物学 |
| 中文摘要 | 本研究通过Solexa测序，SOAPdenovo拼接的方法获得了稻属AA-基因组5个物种（O. nivara、O. glaberrima、O. barthii、O. glumapaetula 和O. meridionalis）的基因组草图。拼接长度从335 Mb至375 Mb不等，蛋白编码区覆盖度均超过95.8%。这一成果为开展稻属AA-基因组物种的比较基因组学研究，阐明植物近缘物种基因组结构变异及进化机制提供了重要基础。在构建二代测序技术拼接平台的过程中，本工作还获得了完整的P. euphratica叶绿体基因组序列。该叶绿体基因组大小为156,766 bp，包含130个已知基因，其中89个属于蛋白编码基因，8个rRNA基因，37个tRNA基因。 |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/25771]  |
| 专题 | 昆明植物研究所_昆明植物所硕博研究生毕业学位论文 |
| 作者单位 | 中国科学院昆明植物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张群洁. 稻属AA-基因组物种的重复序列研究[D]. 北京. 中国科学院大学. 2014. |
入库方式： OAI收割
来源：昆明植物研究所
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