食虫目核心类群的比较分子细胞遗传学研究
文献类型:学位论文
作者 | 叶建平 |
学位类别 | 博士 |
答辩日期 | 2007-06 |
授予单位 | 中国科学院研究生院 |
授予地点 | 北京 |
导师 | 杨凤堂 |
关键词 | 食虫目 染色体涂色 比较染色体图谱 核型进化 |
其他题名 | Comparative molecular cytogenetics of the core insectivores |
学位专业 | 动物学 |
中文摘要 | 食虫目(Order Insectivora)是理解哺乳动物系统进化关系的一个关键类群。然而, 对于其分类以及系统发育的关系,300多年的研究都没有得出一致的结论。染色体在进化过程中所发生的重组可以作为生物分类和系统发育关系的一个指标。通过比较染色体涂色技术(Chromosome Painting)可以从全基因组水平揭示染色体同源关系,并且可以鉴定物种进化过程中所发生的染色体重组。 本论文旨在对分布在我国的猬科、鼹科与鼩鼱科的代表物种的基因组结构进行研究。通过比较染色体涂色的方法,建立了它们与人的基因组同源性。通过人与食虫目主要代表类群的比较染色体涂色研究,我们从全基因组水平揭示了食虫目几个代表类群之间的核型系统发育关系。研究结果表明: 猬科动物具有高度重组的基因组结构。人染色体片段联合HAS 4/8/5和11/15可能是猬科动物的细胞遗传学鉴定特征。 与猬科动物具有高度重组的核型相比,鼹科动物的基因组结构相对保守。染色体臂间的倒位是鼹科核型进化的主要方式。 鼩鼱科中的麝鼩亚科动物具有保守的核型。 以染色体重排作为系统发育指标,鼩鼱科与鼹科相对于猬科,具有比较近的亲缘关系。 食虫目核心类群(猬科,鼹科与鼩鼱科)的基因组结构与现划入Afrotheria超目的象鼩科、无尾猬科和金鼹科的基因组结构有很大的差异。 此外,本研究所构建的比较染色体图谱,有助于已经测序的人的基因组序列信息向其他没有基因定位数据的食虫目动物转移。 |
英文摘要 | Insectivora have traditionally been regarded as one of the key groups in understanding mammalian origins. 300 years of studies have not yet reached a conclusion on the taxonomy and phylogeny of this order. Evolutionary chromosome rearrangements can be regard as phylogenetic markers for the study of taxonomy and phylogenetic relationships. Cross-species chromosome painting, which serves as efficient means for delineating such chromosome rearrangements, is the current method of choice for the cytogenetic mapping of genome-wide chromosomal homologies. In this thesis, I explored the genome organizations of three core insectivore families (i.e. Erinaceidae, Talpidae, and Soricidae) distributed in China. Using cross-species chromosome painting and G-banding, I have, for the first time, established the chromosomal homologies between representative species of these families and human. The results show that: Erinaceids have highly rearranged genomes. The HSA 4/8/5, and 11/15 syntenic associations could be the cytogenetic signatures for Erinaceidae. Unlike erinaceids that have highly rearranged genomes, moles have conserved genomes. Pericentric inversions of chromosome are the major mechanism underlying the karyotype evolution of Talpidae. The Crocidurinae have conserved karyotypes. A close phylogenetic relationship between shrews and moles to the exclusion of hedgehogs. There is markable difference in genome organizations between the core insectivore families and the three traditional insectivore families that have now been included in the superorder Afrotheria. In addition to a better understanding of the karyotypic relationships among insectivores, the comparative maps established in this study will aid the transfer of genomic information from map-rich species (human) to map-poor species (insectivores). |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2010-10-14 |
源URL | [http://159.226.149.42:8088/handle/152453/6100] ![]() |
专题 | 昆明动物研究所_其他 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 叶建平. 食虫目核心类群的比较分子细胞遗传学研究[D]. 北京. 中国科学院研究生院. 2007. |
入库方式: OAI收割
来源:昆明动物研究所
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