海洋小单孢菌SCSIO N160中fluostatins生物合成基因簇的克隆及三个生物合成基因的功能鉴定
文献类型：学位论文
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| 作者 | 杨春芳 |
| 学位类别 | 博士 |
| 答辩日期 | 2016 |
| 导师 | 张长生 |
| 关键词 | II型PKS，fluostatins，重氮化合物，氧化酶，生物合成 |
| 学位专业 | 海洋生物学 |
| 中文摘要 | Fluostatins是从一株南海稀有放线菌Micromonospora rosaria SCSIO N160中筛选分离的芳香聚酮类化合物，该类化合物具有显著的抗菌活性和一定的抗肿瘤活性。结构上，fluostatins具有新颖的6-5-6-6四环结构，含N的六元环结构，含重氮的结构及高度氧化的D环结构。为了解完整的fluostatins生物合成途径并阐明上述结构的形成机制，我们以小单孢菌SCSIO N160为研究对象，克隆了fluostatins的生物合成基因簇。通过对小单孢菌SCSIO N160进行基因组扫描，缺失序列补全及生物信息学分析，我们发现了fluostatins生物合成基因簇。通过全基因组文库的构建和筛选，获得了包含完整fls基因簇的阳性克隆。该基因簇全长约40.128 kb，包含32个主体基因，分别为6个负责聚酮链骨架合成的基因：flsD、flsE、flsC、flsB、flsA、flsI；8个编码氧化还原酶基因：flsO2、flsO3、flsL、flsO1、flsG、flsO4、flsP、flsO5；3个编码调控子和转运子的基因：flsR1、flsR2、flsR3；8个编码与氮原子引入有关酶的基因：flsN1、flsN2、flsT、flsS、flsN3、flsN4、flsV、flsU2；7个编码其他后修饰蛋白和未知功能蛋白的基因：flsF、flsK、flsU1、flsQ1、flsM、flsH、flsQ2。 |
| 源URL | [http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/14661]  |
| 专题 | 南海海洋研究所_学位论文（硕士） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 杨春芳. 海洋小单孢菌SCSIO N160中fluostatins生物合成基因簇的克隆及三个生物合成基因的功能鉴定, Clone of Fluostatins Biosynthetic Gene Clusters from Micromonospora rosaria SCSIO N160 and Functional Identification of Three Biosynthetic Genes[D]. 2016. |
入库方式： OAI收割
来源：南海海洋研究所
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