基于高通量测序分析青藏高原特有植物蓝玉簪龙胆(Gentiana veitchiorum)的SSR和SNP特征
文献类型:期刊论文
作者 | 田尊哲; 高庆波; 陈世龙![]() |
刊名 | 植物研究
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出版日期 | 2016 |
期号 | 5页码:747-752 |
关键词 | 蓝玉簪龙胆 高通量测序 微卫星 单核苷酸多态性 青藏高原 |
中文摘要 | 利用Illumina HiSeq ~(TM)2500平台对青海省库泽县的蓝玉簪龙胆(Gentiana veitchiorum)进行高通量测序,共得到SSR序列8 588条,对其SSR重复类型进行分析;三核苷酸重复类型所占的比例最大占54.7%(4696);其次是二核苷酸重复类型占41.3%(3543);四核苷酸重复类型,五核苷酸重复类型和六核苷酸重复类型所占的比例较少(共占4%)。在二核苷酸重复类型中AT/TA重复类型所占的比例最大分别为9.85%和9.5%。在微卫星中重复单元的长度大小和重复次数成负相关,并且微卫星的总长度与重复单元的长度成正相关。在蓝玉簪龙胆的花(GP-F)和叶(GP-L)... |
源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/6553] ![]() |
专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 田尊哲,高庆波,陈世龙,等. 基于高通量测序分析青藏高原特有植物蓝玉簪龙胆(Gentiana veitchiorum)的SSR和SNP特征[J]. 植物研究,2016(5):747-752. |
APA | 田尊哲,高庆波,陈世龙,&张发起.(2016).基于高通量测序分析青藏高原特有植物蓝玉簪龙胆(Gentiana veitchiorum)的SSR和SNP特征.植物研究(5),747-752. |
MLA | 田尊哲,et al."基于高通量测序分析青藏高原特有植物蓝玉簪龙胆(Gentiana veitchiorum)的SSR和SNP特征".植物研究 .5(2016):747-752. |
入库方式: OAI收割
来源:西北高原生物研究所
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