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四步法消除SYBR GreenⅠ实时定量RT-PCR中引物二聚体的影响

文献类型:期刊论文

作者张驰宇1,2; 张高红1,2; 杨敏1; 贲昆龙[*]1
刊名中国生物化学与分子生物学报
出版日期2004
卷号20期号:3页码:387-392
关键词引物二聚体 荧光实时定量RT-PCR SYBR greenⅠ 四步法 RNA 定量
通讯作者kben@vip.sina.com
合作状况其它
中文摘要为建立一种新的SYBR greenⅠ实时定量RT-PCR方法,使之能够有效消除引物二聚体(PDs)对实时定量结果的影响,对RT-PCR特异性扩增产物和PDs分别进行了凝胶电泳检测和熔解曲线分析,依据PDs和扩增产物的熔解温度(Tm)特点,在通用的三步法的延伸步骤之后,增加一个短暂的(5s)恒温和荧光检测步骤,使这个步骤的温度高于PDs的Tm,但低于扩增产物的Tm,简称该法为四步法,PDs的Tm通常高于72℃,但低于扩增产物的Tm,将四步法第四步的温度设置在高于PDs的Tm,但低于扩增产物的Tm时,四步法能够有效地消除PDs的影响,对三步法和四步法SYBR greenⅠ实时定量RT-PCR进行了比较,发现三步法根本不能用于RNA的实时定量,而四步法能够实现包括低丰度RNA在内的RNA的定量,选择Tm值尽可能小的引物,使PDs与扩增产物Tm值之间有足够的差距,将更有利于四步法的应用,并可成功地用于低丰度RNA的准确定量。
收录类别其他
资助信息国家自然科学基金项目 (No .3 0 170 894)
语种中文
公开日期2013-06-26
源URL[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/7527]  
专题昆明动物研究所_分子免疫药理学
作者单位1.中国科学院昆明动物研究所分子与细胞免疫学实验室,昆明650223
2.中国科学院研究生院,北京100039
推荐引用方式
GB/T 7714
张驰宇,张高红,杨敏,等. 四步法消除SYBR GreenⅠ实时定量RT-PCR中引物二聚体的影响[J]. 中国生物化学与分子生物学报,2004,20(3):387-392.
APA 张驰宇,张高红,杨敏,&贲昆龙[*].(2004).四步法消除SYBR GreenⅠ实时定量RT-PCR中引物二聚体的影响.中国生物化学与分子生物学报,20(3),387-392.
MLA 张驰宇,et al."四步法消除SYBR GreenⅠ实时定量RT-PCR中引物二聚体的影响".中国生物化学与分子生物学报 20.3(2004):387-392.

入库方式: OAI收割

来源:昆明动物研究所

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