中国科学院机构知识库网格系统: 文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析

文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析

文献类型：期刊论文


作者	廖承红 1; 王华伟 2; 梁浩 1; 张建行 1; 韦双双 1; 周海龙 1
刊名	广东农业科学
出版日期	2012
期号	12 页码:145-147
关键词	文昌鸡线粒体DNA D-loop 遗传多样性
其他题名	Genetic diversity of mitochondrial DNA D-loop sequences of Hainan Wenchang chicken
合作状况	其它
中文摘要	运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29%。用DnaSP软件估计出序列存在16个单倍型,单倍型多样度（Hd）为0.935,核苷酸多样度（π）为0.01479,平均核苷酸差异数（k）为7.541。运用Mega4.0软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ系统树。文昌鸡样品在NJ无根树上聚为4大分支。研究结果表明,文昌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示文昌鸡在遗传组成上具有4个母系来源。
英文摘要	The PCR technique was used to amplify the mtDNA D-loop from 90 individuals of Hainan Wenchang chicken and the products were directly sequenced.By using CLUSTAL X 1.81 to align and compare the sequences,27 mutation sites in 38 samples were observed,all of which were transitions.5.29% mutation rate were found.As estimated by DNAsp,there were 16 haplotypes within the population.Haplotype diversity（Hd）,nucletide diversity（π） and the average number of nucletide differences（k） were 0.935,0.01479 and 7.541,respectively.The pairwise genetic distance and the unrooted NJ phylogenetic tree obtained by Mega4.0.All of 38 samples were clusted in 4 clades.In the research,it could be concluded that the genetic diversity was relatively rich and wealthy and there were 4 maternal origins to Wenchang chicken population.
收录类别	其他
资助信息	海南省自然科学基金（310036）;海南省教育厅高等学校科学研究项目（Hjkj201l一11）;海南大学青年基金（qnjjl017）;海南大学科研启动项目（Kyqdl116）
语种	中文
公开日期	2013-06-18
源URL	[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/7502]
专题	昆明动物研究所_分子人类学昆明动物研究所_遗传资源与进化国家重点实验室
作者单位	1.海南大学农学院,海南海口570228 2.中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,云南昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	廖承红,王华伟,梁浩,等. 文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析[J]. 广东农业科学,2012(12):145-147.
APA	廖承红,王华伟,梁浩,张建行,韦双双,&周海龙.(2012).文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析.广东农业科学(12),145-147.
MLA	廖承红,et al."文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析".广东农业科学 .12(2012):145-147.

入库方式： OAI收割

来源：昆明动物研究所

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