生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较
文献类型:期刊论文
作者 | 石秀凡1; 倪向善2; 凌伦奖2 |
刊名 | 生物物理学报
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出版日期 | 1989 |
卷号 | 5期号:3页码:246-251 |
关键词 | 抽样法 平移扩散 生物分子 抽样效率 平衡态 |
ISSN号 | 1000-6737 |
合作状况 | 其它 |
中文摘要 | 本文采用先前所用的一个中性丙氨酸分子加56个水分子的体系,对力偏倚(FB)抽样法和Metropolis抽样法进行了比较.发现用FB法,由体系的晶体点阵构型出发到达平衡态所需的循环数为Metropolis法的五分之二.为了得到较好的结构信息所需的构型数也仅为后者的五分之二.虽然每个循环所需机时为Metropolis法的1.6倍,仍是一加速收敛的好方法.本文进一步支持了以分子的平移扩散作为判别抽样效率的判据,指出接受几率在0.33——0.36之间的步长可能是合适的.此外还统计了和丙氨酸作用大于2keal/mol的分子的坚标,使它们与丙氨酸—水分子径向分布图的峰值相对应. |
收录类别 | 其他 |
资助信息 | 家自然科学基金资助项目 |
原文出处 | 198953246.pdf |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2010-08-24 |
源URL | [http://159.226.149.42:8088/handle/152453/2933] ![]() |
专题 | 昆明动物研究所_其他 |
作者单位 | 1.中国科学院昆明动物研究所 2.中国科学院生物物理研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 石秀凡,倪向善,凌伦奖. 生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较[J]. 生物物理学报,1989,5(3):246-251. |
APA | 石秀凡,倪向善,&凌伦奖.(1989).生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较.生物物理学报,5(3),246-251. |
MLA | 石秀凡,et al."生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较".生物物理学报 5.3(1989):246-251. |
入库方式: OAI收割
来源:昆明动物研究所
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