中国科学院机构知识库网格系统: Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号

Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号

文献类型：期刊论文


作者	张静[*]1; 石秀凡 3; 刘次全 2,3
刊名	生物化学与生物物理进展
出版日期	2001
卷号	28 期号:4 页码:523-527
关键词	Yeast 多聚腺苷作用信号 mRNA二级结构
ISSN号	1000-3282
其他题名	Secondary structure of yeast genomic downstream region and polyadenylation signals
通讯作者	jzhang213@263.net
合作状况	其它
中文摘要	形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷（poly(A)）作用涉及前体mRNA下游的三个元件：效率元件（EE）、定位元件（PE）以及实际的剪切和poly(A)作用位点，实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成.对180个Yeast基因下游（终止密码子后200个碱基）二级结构进行的详细分析显示，约86%的EE、89%的PE与二级结构中碱基非配对的环(发夹环、膨胀环、内环或多分支环)区或连接单链区有关.这个结果提示，反式因子对EE和PE的识别和作用在一定程度上有赖于EE和PE的二级结构特征.借助mRNA二级结构可以提高对EE和PE位点预测的准确性.
英文摘要	Polyadenylation of 3 ' -forming in eukaryote concerns three elements located in precursor mRNA downstream region: efficiency element (EE), position element (PE) and the actual site for cleavage and polyadenylation. Several base sequences of EE and PE have been proposed by many experiments. The secondary structures of 180 yeast genomic downstream regions (200 bases downstream the stop codon), have been analysed in detail. It is showed that about 86 % of EE sites and 89 % of PE sites are related to the regions of non-paired loop (hairpin loop, bulge loop, interior loop or multi-branched loop) or to connecting single strand. This result suggests that the identifications and actions of EE and PE by trans-factors, to certain extent, are dependent on the structural features of EE and PE in the secondary structure. According to the secondary structure of mRNA, the prediction accuracy of EE and PE sites may be improved.
收录类别	其他
原文出处	2001284523.pdf
语种	中文
公开日期	2010-08-24
源URL	[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/3763]
专题	昆明动物研究所_其他
作者单位	1.云南大学应用统计中心,昆明650091 2.云南大学现代生物中心,昆明650091 3.中国科学院昆明动物研究所,昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	张静[*],石秀凡,刘次全. Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号[J]. 生物化学与生物物理进展,2001,28(4):523-527.
APA	张静[*],石秀凡,&刘次全.(2001).Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号.生物化学与生物物理进展,28(4),523-527.
MLA	张静[*],et al."Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号".生物化学与生物物理进展 28.4(2001):523-527.

入库方式： OAI收割

来源：昆明动物研究所

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