铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究
文献类型：期刊论文
| 作者 | 陈泽斌1,2; 李冰[*]3; 徐胜光1; 靳松1; 任禛1; 王定康4; 余磊1; 刘佳妮1 |
| 刊名 | 福建农业学报
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| 出版日期 | 2015 |
| 卷号 | 30期号:10页码:978-983 |
| 关键词 | 铁皮石斛 内生真菌 高通量测序 构巢裸壳孢菌 |
| 其他题名 | Diversity of Endophytic Fungi in Leaves of Dendrobium candidum |
| 通讯作者 | libing@mail.kiz.ac.cn |
| 中文摘要 | 为检测铁皮石斛内生真菌种类,采用高通量测序技术测定铁皮石斛内生真菌的ITS2区序列,用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度和Alpha多样性。获得的有效序列和OTU数为41361/33;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和。铁皮石斛内生真菌主要分布于裸胞壳属Emericella,构巢裸壳孢菌Emericella nidulans是铁皮石斛内生真菌的优势种群。 |
| 英文摘要 | To determine the diversity of the endophytic fungi grown on Dendrobium candidum,the ITS2 region from the samples was sequenced using the Illumina MiSeq high-through put sequencing method.The number of sequences and operational taxonomic units（OTUs）of each sample were sorted and calculated using Qiime and Mothur software.The species abundance and distribution,alpha diversity index,and time of species abundance of the fungi were determined.The number of effective sequences was found to be 41 361;and the OTUs was 33.The rarefaction functions indicated an adequate sampling,while the OTU number was close to saturation.It was concluded that the endophytic fungi found in D.candidumbelonged to Emericella,and E.nidulans was the dominant species. |
| 资助信息 | 国家自然科学基金项目（31460491）; 云南省科技厅应用基础研究计划青年项目（2013FD040）; 云南省教育厅科学研究项目（2014Y390）; 昆明学院人才引进项目（YJL14005）; 云南省高校优势特色重点学科（生态学）建设项目资助 |
| 收录类别 | 其他 |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://159.226.149.26:8080/handle/152453/9702]  |
| 专题 | 昆明动物研究所_中国科学院昆明灵长类研究中心 |
| 作者单位 | 1.昆明学院农学院,云南昆明650214 2.云南省都市特色农业工程技术研究中心,云南昆明650214 3.中国科学院昆明动物研究所,云南昆明650223 4.昆明学院生命科学与技术系,云南昆明650214 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 陈泽斌,李冰[*],徐胜光,等. 铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究[J]. 福建农业学报,2015,30(10):978-983. |
| APA | 陈泽斌.,李冰[*].,徐胜光.,靳松.,任禛.,...&刘佳妮.(2015).铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究.福建农业学报,30(10),978-983. |
| MLA | 陈泽斌,et al."铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究".福建农业学报 30.10(2015):978-983. |
入库方式： OAI收割
来源：昆明动物研究所
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