青稞转录组SSR位点及其基因功能分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 徐金青; 夏腾飞; 王蕾; 王寒冬; 张怀刚; 刘登才; 昌西; 沈裕虎 |
| 刊名 | 麦类作物学报
 |
| 出版日期 | 2017 |
| 期号 | 2页码:175-184 |
| 关键词 | 青稞 转录组 SSR 功能注释 |
| 中文摘要 | 为了探讨青稞转录中SSR位点信息及其所在基因的生物学功能,使用MISA软件分析青稞转录组中SSR的分布频率和重复基元的基本类型,通过BLASTX对含有SSR的Unigene与nr、COG、Swiss-Prot和KEGG等公共数据库进行比对和功能注释。结果表明,在青稞转录组拼接得到的58 065个Unigene中发现9 576条序列中含有11 930个SSR位点,SSR发生频率为16.49%,平均每6.63kb出现1个SSR位点,共有119种重复基元(motif)。青稞转录组SSR出现频率最高的是三核苷酸重复基元(64.19%),其次是二核苷酸重复基元(24.05%)。AG/CT和AGG/CCT... |
| 源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/6975]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 徐金青,夏腾飞,王蕾,等. 青稞转录组SSR位点及其基因功能分析[J]. 麦类作物学报,2017(2):175-184. |
| APA | 徐金青.,夏腾飞.,王蕾.,王寒冬.,张怀刚.,...&沈裕虎.(2017).青稞转录组SSR位点及其基因功能分析.麦类作物学报(2),175-184. |
| MLA | 徐金青,et al."青稞转录组SSR位点及其基因功能分析".麦类作物学报 .2(2017):175-184. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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