本发明属于光学领域，尤其涉及一种压缩编码光谱成像系统的模板标定方法。通过该标定方法，可以获取更接近设计要求的模板数据，从而构造更准确的稀疏投影矩阵，以重构更准确的观测图谱信息。同时，该标定方案，不同于传统色散系统的标定，它综合考虑系统成像效果，编码模板编码效果及色散信息，并将物理标定方法和数据处理方法于一体，因此，该标定方法更为全面一致。本发明达到了能够对模板的实际编码调制信息进行标定，包括对系统成像响应，编码信息、色散信息等完成标定，最终服务于稀疏重构模型和算法，以获得更准确的目标图谱信息的有益效果。