5种鳎科鱼类核糖体ITS1序列比较
文献类型：期刊论文
| 作者 | 龚理; 时伟; 杨敏; 司李真; 孔晓瑜 |
| 刊名 | 水产学报
 |
| 出版日期 | 2017 |
| 卷号 | 41期号:03页码:321-329 |
| 关键词 | 鳎科 内转录间隔区 种类鉴定 分子标记 假基因 非协同进化 聚类分析 |
| 通讯作者 | 龚理 |
| 中文摘要 | 核糖体基因在很长一段时间内被认为严格遵循协同进化方式,但是在很多种类中都发现了明显的序列多态性,表明其是非协同进化。为了检测鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1(ITS1)序列是否存在多态性,并探究其能否作为种类鉴定的分子标记,本研究克隆获得了5种鳎科鱼类共118条ITS1全序列。结果显示,眼斑豹鳎具有两种差异显著的片段类型,表明其在基因组中遵循非协同进化方式;而在其余4种鳎科鱼类中均没有发现序列多态性,表明其为协同进化。序列分析显示ITS1具有明显的种间长度异质性,最短的序列出现在蛾眉条鳎(412 bp),最长的为眼斑豹鳎(585 bp)。碱基分析显示ITS1序列在5种鳎科鱼类中都呈现出相同的趋势:C>G>A>T,且GC含量为69.5%,远高于AT含量。聚类分析显示除眼斑豹鳎外,所有鳎类均单独聚为一支,种类区分度非常明显,表明ITS1序列能够作为种类鉴定的分子标记。但是眼斑豹鳎的一个克隆和东方箬鳎聚为一支,这种序列多态性对种类鉴定产生了干扰,因此用具有多态的ITS1序列作为分子标记时一定要有足够的克隆数量,避免因数据不充分而得到不正确的结论。 |
| 源URL | [http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/17336]  |
| 专题 | 南海海洋研究所_中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 龚理,时伟,杨敏,等. 5种鳎科鱼类核糖体ITS1序列比较[J]. 水产学报,2017,41(03):321-329. |
| APA | 龚理,时伟,杨敏,司李真,&孔晓瑜.(2017).5种鳎科鱼类核糖体ITS1序列比较.水产学报,41(03),321-329. |
| MLA | 龚理,et al."5种鳎科鱼类核糖体ITS1序列比较".水产学报 41.03(2017):321-329. |
入库方式： OAI收割
来源：南海海洋研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。