基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现
文献类型：会议论文
| 作者 | 费辉 ; 张云泉 ; 王靖 |
| 出版日期 | 2011 |
| 会议名称 | 2011年全国高性能计算学术年会(HPC china2011) |
| 会议日期 | 2011 |
| 会议地点 | 济南 |
| 关键词 | 非标记定量 蛋白质组 QuantWiz GPU 并行计算 |
| 页码 | 1-6 |
| 中文摘要 | QuantWiz是一款基于质谱的非标记定量软件，很好地应用于定量蛋白质组学。随着实验数据的日益增大，使得定量的计算量巨大，耗费时间长。GPU以几百GFlops甚至上TFlops的运算能力，为定量蛋白质组学这样的计算密集型应用提供了良好的加速方案。本文对QuantWiz软件做了深入的研究与分析，找到了软件性能的热点模块所在，提出了该软件在GPU上的加速方案——GPU-QuantWiz，并进行了实现。性能测试显示，在Tesla C1060上，该方案的平均加速比达到了9.66倍，得到了良好的加速效果。同时，该方案还可以扩展到两块及以上的GPU上，具有良好的可扩展性。 |
| 收录类别 | WANFANG |
| 会议主办者 | 中国计算机学会 |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/16330]  |
| 专题 | 软件研究所_软件所图书馆_会议论文 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 费辉,张云泉,王靖. 基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现[C]. 见:2011年全国高性能计算学术年会(HPC china2011). 济南. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：软件研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。