基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现
文献类型:会议论文
作者 | 詹科 ; 张云泉 ; 王婷 ; 郑晶晶 ; 张鹏 |
出版日期 | 2013 |
会议名称 | 2013全国高性能计算学术年会 |
会议日期 | 2013 |
会议地点 | 桂林 |
关键词 | FASTQ 数据压缩 DSRC Pthreads |
页码 | 782-786 |
中文摘要 | 高通量测序仪产生大量的DNA 数据,FASTQ 是存储DNA 数据被广泛使用的数据格式.对FASTQ 格式的数据进行压缩处理,能有效的节省存储空间.DSRC 算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC 算法进行并行,能提高压缩FASTQ 格式的DNA 数据的效率.本文基于Pthreads,并行了DSRC 算法,测试结果表明,当使用4线程,加速比达到3.5. |
语种 | 中文 |
源URL | [http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/16564] ![]() |
专题 | 软件研究所_软件所图书馆_会议论文 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 詹科,张云泉,王婷,等. 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现[C]. 见:2013全国高性能计算学术年会. 桂林. 2013. |
入库方式: OAI收割
来源:软件研究所
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