鳗弧菌铁载体相互作用蛋白SIP结构与功能的初步研究
文献类型:学位论文
作者 | 韩誉![]() |
答辩日期 | 2018-05-14 |
文献子类 | 硕士 |
授予单位 | 中国科学院大学 |
授予地点 | 中国科学院海洋研究所 |
导师 | 马庆军 |
关键词 | 鳗弧菌 铁获取系统 铁载体相互作用蛋白 晶体结构 |
学位名称 | 工程硕士 |
学位专业 | 生物工程 |
英文摘要 | 由鳗弧菌(Vibrio anguillarum)引起的弧菌病是海水养殖业的顽疾,给渔业生产造成了严重的经济损失。前期研究发现,铁的运输和利用在鳗弧菌775致病过程中发挥着重要作用,其中以铁载体鳗弧菌素(anguibactin)介导的铁获取系统作用最为显著。该系统主要分为鳗弧菌素的合成、释放、铁(III)-铁载体复合物的转运、体内铁离子的释放以及铁运输的调节五个方面。相较于其他四个方面,关于铁释放的分子机制研究几近空白。 通过基因序列比对发现,在鳗弧菌775基因组中存在一个编码铁载体相互作用蛋白SIP(siderophore-interacting protein)的基因序列。在其他致病菌,如大肠杆菌中,SIP能够将铁载体中结合的三价铁还原成二价铁,从而降低铁与铁载体的结合能力来释放铁离子以满足自身需要。因此,对于鳗弧菌775 SIP(VaSIP)结构与功能的研究有助于理解铁(III)-鳗弧菌素复合物中铁释放的机制。本论文的主要工作和研究结果如下: 通过大肠杆菌表达系统获得了重组蛋白VaSIP;分子筛层析色谱法分析表明VaSIP在溶液中以单体形式存在;光谱扫描分析显示VaSIP重组蛋白携带黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)。利用分子置换法成功解析了分辨率为1.11 Å的VaSIP晶体结构,这是目前SIP蛋白家族中分辨率最高的结构。晶体结构显示VaSIP由5个α螺旋和12个β折叠组成,可分成三个结构部分:N端的β桶、α螺旋-β折叠-α螺旋构成的"三明治"结构和C端的一个α螺旋。同时发现,VaSIP主要通过氢键和苯环堆叠与FAD相互作用,在SIP家族中具有保守性。整体比对SIP家族结构已知蛋白,发现它们的折叠方式基本一致,但是存在多处序列插入和缺失变化。其中VaSIP的C端具有新颖的α螺旋结构,与其所识别的特异性底物相适应。 为验证VaSIP在鳗弧菌775铁释放过程中的作用,我们利用基因敲除技术获得了鳗弧菌775 sip的缺失株△sip,△sip与野生型的生长曲线测定结果显示,在低铁环境下sip的缺失并未影响鳗弧菌775的生长;同时斑马鱼侵染实验结果表明,突变株的毒性也没有降低,这都暗示着在鳗弧菌775中可能还存在着其他的铁释放途径。 |
学科主题 | 微生物生物化学 |
语种 | 中文 |
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页码 | 73 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/154503] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 韩誉. 鳗弧菌铁载体相互作用蛋白SIP结构与功能的初步研究[D]. 中国科学院海洋研究所. 中国科学院大学. 2018. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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