亚热带森林乔木树种DNA条形码研究以哀牢山自然保护区为例
文献类型:期刊论文
作者 | 卢孟孟; 慈秀芹; 杨国平; 李捷![]() |
刊名 | 植物分类与资源学报
![]() |
出版日期 | 2013 |
卷号 | 35期号:6页码:733-741 |
ISSN号 | 2095-0845 |
其他题名 | DNA Barcoding of Subtropical Forest Trees --A Study from Ailao Mountains Nature Reserve, Yunnan, China |
英文摘要 | 作为新一代植物志iFlora的重要组成部分,DNA条形码已经成为物种鉴定中重要且有效的方法。本研究以亚热带森林的乔木树种为研究对象,开展了DNA条形码的尝试性工作。为评估DNA条形码对鉴定亚热带森林树种的有效性,收集并研究了来自哀牢山自然保护区内51科111属中204个树种的525个乔木个体。结果显示,所选4个DNA片段(rbcL, matK, trnHpsbA和ITS)的PCR扩增成功率都超过90%;测序成功率rbcL和matK最高,分别为90.7%和90.5%,trnHpsbA次之(83.6%),ITS最低(73.5%),表明4个片段在亚热带森林乔木中都具有较好的通用性。应用BLAST与NJ Tree两种方法,对物种和属水平的鉴别成功率进行统计,发现单片段中ITS最高,分别为68.4%~81.3%和99.0%~100%, 核心条码rbcL和matK组合的成功率是52.8%~60.2%和86.7%~90.5%,再与补充条码trnHpsbA和ITS联合,可以成功鉴别74.7%~79.6%哀牢山自然保护区亚热带森林中的乔木物种。由于ITS片段在亚热带森林部分重要树种类群(樟科和壳斗科等)中的测序成功率较差,所以对这些植物类群采用trnHpsbA作为DNA条形码是一个更好的选择。 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2017-09-30 |
源URL | [http://ir.xtbg.org.cn/handle/353005/10662] ![]() |
专题 | 西双版纳热带植物园_植物系统与保护生物学研究组 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 卢孟孟,慈秀芹,杨国平,等. 亚热带森林乔木树种DNA条形码研究以哀牢山自然保护区为例[J]. 植物分类与资源学报,2013,35(6):733-741. |
APA | 卢孟孟,慈秀芹,杨国平,&李捷.(2013).亚热带森林乔木树种DNA条形码研究以哀牢山自然保护区为例.植物分类与资源学报,35(6),733-741. |
MLA | 卢孟孟,et al."亚热带森林乔木树种DNA条形码研究以哀牢山自然保护区为例".植物分类与资源学报 35.6(2013):733-741. |
入库方式: OAI收割
来源:西双版纳热带植物园
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明,本系统中所有内容都受版权保护,并保留所有权利。