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H3K27me3去甲基化酶JMJD3和UTX在体细胞重编程中的作用和机制研究

文献类型:学位论文

作者张辉
答辩日期2015-10-01
文献子类博士
授予单位中国科学院大学
授予地点广州生物院
导师赖良学 ; 秦宝明
关键词体细胞重编程 H3K27me3 JMJD3 UTX
学位名称理学博士
学位专业生物化学与分子生物学
其他题名Roles and mechanisms of H3K27me3 demethylases JMJD3 and UTX in somatic cell reprogramming
英文摘要诱导多能性干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs)的诞生为干细胞研究和再生医学带来新的机遇和希望。但是经典的诱导iPSCs的方法不仅效率低而且周期很长。后续研究发现,体细胞重编程中存在多种表观遗传学障碍,这些障碍不仅抑制重编程效率,而且对获得的iPSCs的质量也很可能有巨大的影响。因此,如何发现并克服这些障碍是iPSCs研究领域一直以来的关键问题之一。我们实验室之前的研究发现维生素C大大提高重编程效率,这一作用很大程度上与组蛋白去甲基化有关,组蛋白H3K9和H3K36的去甲基化酶都可以显著的提高重编程效率。在本论文工作中,我们从另外一个重要的组蛋白甲基化位点H3K27me3入手,探索在重编程中去甲基化酶UTX和JMJD3的作用和机制。我们发现:1,JMJD3过表达显著提高重编程效率,而UTX过表达对重编程没有影响;全程敲低JMJD3和UTX均显著抑制重编程的进行,但在后期两者作用相反,JMJD3依然促进、但UTX则抑制重编程效率。2,与以往报道一致,我们确认了JMJD3抑制细胞增殖,而UTX对细胞增殖没有影响。3,利用RNA-seq我们发现,敲低UTX和JMJD3在重编程早期对基因表达造成不同的影响,JMJD3(而不是UTX)显著影响间充质向上皮转换(MET)相关基因表达。4,利用免疫沉淀(IP)技术我们发现,JMJD3与KLF4、P300、CDK9直接相互作用,结合ChIP-seq的结果以及已报道的JMJD3相互作用蛋白我们最终提出JMJD3的做用机制很可能是经过KLF4特异性的招募,在靶基因在增强子区、启动子区和gene body上完成去甲基化,促进基因转录激活。综上所述,本论文通过全面比较分析JMJD3和UTX在Vc重编程中的作用和机制,完善了我们对体细胞重编程中H3K27去甲基化与基因转录调控之间的密切关联的理解,同时有助于进一步优化重编程技术。
学科主题生物化学与分子生物学
语种中文
页码100
源URL[http://ir.foo.ac.cn/handle/2SETSVCV/1090]  
专题中国科学院广州生物医药与健康研究院
作者单位中国科学院广州生物医药与健康研究院
推荐引用方式
GB/T 7714
张辉. H3K27me3去甲基化酶JMJD3和UTX在体细胞重编程中的作用和机制研究[D]. 广州生物院. 中国科学院大学. 2015.

入库方式: OAI收割

来源:广州生物医药与健康研究院

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