广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 朱冰 ; 钟家禹 ; 李潇 ; 陈翊 ; 林涛 ; 吴灶和 ; 周荣 ; 龚四堂 |
| 刊名 | 中华微生物学和免疫学杂志
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| 出版日期 | 2006 |
| 卷号 | 26期号:10页码:926-928 |
| 关键词 | 星状病毒 基因组 4型基因型 序列分析 |
| ISSN号 | 0254-5101 |
| 中文摘要 | 目的 探讨广州地区儿童感染的星状病毒基因组分子结构特点和基因型.方法 参考GenBank上的星状病毒基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增星状病毒基因组,克隆于T载体上,序列测定,用Clustal W和DNAStar软件分析基因组序列.结果 星状病毒HASTVgz01全基因组为6721 bp,提交到GenBank上的序列号为DQ344027,其中5＇端非编码区（5＇UTR）长82bp,3＇端非编码区末端长81 bp,病毒基因组编码区全长6558个核苷酸,分别编码ORF1a、ORF1b、ORF2,ORF1a基因长2763 bp（83～2845 nt）,ORF1b基因长1557bp（2785～4332 nt）,其中ORF1a、ORF1b两基因有71个核苷酸的重叠区;ORF2全长2316 nt,位于基因组中4325～6640 nt.ASTVgz01与GenBank中8种基因型星状病毒的ORF2基因氨基酸序列同源性比较发现,HASTVgz01与4型的同源性为93%,其他的同源性在61%～70%之间.结论 广州地区儿童腹泻感染的星状病毒HASTVgz01全基因组为6721bp,GenBank序列号为DQ344027,HASTVgz01与4型星状病毒的ORF2基因氨基酸序列比较同源性为最高,确认HASTVgz01是4型星状病毒. |
| 公开日期 | 2011-07-05 |
| 源URL | [http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/7999]  |
| 专题 | 南海海洋研究所_中科院边缘海地质重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 朱冰,钟家禹,李潇,等. 广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析[J]. 中华微生物学和免疫学杂志,2006,26(10):926-928. |
| APA | 朱冰.,钟家禹.,李潇.,陈翊.,林涛.,...&龚四堂.(2006).广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析.中华微生物学和免疫学杂志,26(10),926-928. |
| MLA | 朱冰,et al."广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析".中华微生物学和免疫学杂志 26.10(2006):926-928. |
入库方式： OAI收割
来源：南海海洋研究所
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