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鳜凋亡相关基因的克隆与功能研究

文献类型:学位论文

作者高原
学位类别博士
答辩日期2006-07-05
授予单位中国科学院水生生物研究所
授予地点水生生物研究所
导师聂品
关键词细胞凋亡 鳜肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体 鳜肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体的诱骗受体 鳜Mst3和SOK1相关激酶 基因超表达
中文摘要鳜(Siniperca chuatsi)是我国一种重要的淡水养殖鱼类,但是各种疾病的发生严重影响着其产量,免疫防治是控制疾病的重要而有效的途径。细胞凋亡是鱼类非特异性免疫调节的一个重要方面,本文对鳜凋亡相关基因进行了克隆鉴定及功能研究。 通过构建SMART cDNA文库并结合RACE技术首次在鳜中克隆到三个凋亡相关基因,并采用PCR和Genome Walking的方法克隆这三个基因及其启动子区域。鳜肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(ScTRAIL)基因cDNA全长1359 bp,5′和3′非翻译区分别为112 bp和395 bp,开放阅读框包含852 bp,编码283 aa,基因全长9021 bp,含有6个外显子和5个内含子。启动子区域732 bp,缺乏典型的TATA或CAAT结构,但存在Oct-1、Sp-1、NF-1、RAP-1、C/EBPalp、NF-kappaB和AP-1等潜在的转录因子结合位点。 鳜肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体的诱骗受体(ScDcTRAILR)基因,cDNA全长2494 bp,5′和3′非编码区分别为106 bp和1326 bp,开放阅读框包含1062 bp,编码353 aa,基因全长10437 bp,含有10个外显子和9个内含子。启动子区域804 bp,缺乏典型的TATA框或CAAT盒,但有一些特异的转录因子结合位点,如C/EBPalp、Sp-1、Oct-1和GATA-1等。 鳜Mst3和SOK1相关激酶(ScMASK)基因,cDNA全长1743 bp,5′和3′非编码区分别为161 bp和364 bp,开放阅读框包含1218 bp,编码405 aa,基因全长8561 bp,包含有9个外显子和8个内含子。启动子区域1526 bp,缺乏典型的TATA框或CAAT盒,存在Oct-1、Sp-1、NF-1、RAP-1、C/EBPalp、NF-kappaB和AP-1等潜在的转录因子结合位点。Southern blotting分析表明在鳜基因组中,ScTRAIL基因为单拷贝基因,在此基础上采用荧光定量PCR方法揭示ScDcTRAILR和ScMASK基因也是单拷贝基因。 对三个基因转录和表达产物的器官组织分布进行了详细的分析。RT-PCR表明这三个基因在健康鳜组织中呈组成型表达,且三者具有不同的组织分布模式。分别构建ScTRAIL、ScDcTRAILR和ScMASK基因的原核表达质粒,通过原核表达、表达蛋白纯化、并制备多克隆抗体,对头肾、肾脏、肝脏、脾脏、肠、皮肤、心脏、脑、鳃和心脏等器官中的目的基因蛋白进行的免疫印迹,发现ScTRAIL蛋白分布于各个组织中,在头肾、性腺中显示较强的带,在脑中的带较弱。ScDcTRAILR蛋白在脾脏、脑、心脏和鳃中有明显的分布,在其它组织中带很弱或没有。ScMASK蛋白在鳃、肝脏、脑中有明显的带被标记。 模拟病原感染的情况,采用荧光定量PCR中的相对定量方法分析这三个基因在LPS或PolyI:C诱导后变化表达,发现ScTRAIL的表达在诱导前后变化不明显。ScDcTRAILR在LPS诱导组的头肾中呈上调表达,在肝脏、脾脏、肾脏、皮肤和心脏中下调;在PolyI:C诱导组,该基因表达量在头肾、肾脏中有显著的上调,在肝脏、心脏中有较大的下调。ScMASK基因的表达在两个诱导组中的头肾和心脏中有明显的上调,在Poly I:C刺激下,肝脏和脾脏中也检测到该基因的上调表达,在其它组织中则有下调趋势。 利用荧光显微镜观察、核酸电泳以及流式细胞术等方法研究了ScTRAIL、ScDcTRAILR和ScMASK在Hela细胞中超表达对细胞的影响。ScTRAIL和ScMASK基因具有促进肿瘤细胞凋亡的作用。ScDcTRAILR在Hela细胞中不能引起细胞发生凋亡现象。
语种中文
公开日期2010-11-16
页码120
源URL[http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/11968]  
专题水生生物研究所_中科院水生所知识产出(2009年前)_学位论文
推荐引用方式
GB/T 7714
高原. 鳜凋亡相关基因的克隆与功能研究[D]. 水生生物研究所. 中国科学院水生生物研究所. 2006.

入库方式: OAI收割

来源:水生生物研究所

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