齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J]
文献类型：期刊论文
| 作者 | 蔡明; 高贝; 张道远; CAI Ming; GAO Bei; ZHANG Dao-yuan; 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,新疆乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049 |
| 刊名 | 生物信息学
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| 出版日期 | 2013 |
| 卷号 | 11期号:3页码:216-223 |
| 关键词 | 齿肋赤藓 热激蛋白60 电子克隆 生物信息学分析 Syntrichia CanInervis Heat Shock ProteIn 60(Hsp60) In Silico clonIng bioInformatics |
| 英文摘要 | 用电子克隆方法获得耐旱苔藓齿肋赤藓的热激蛋白60基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、结构保守域、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、二级结构、功能域、活性位点、及同源性等方面进行了预测和分析.结果表明:齿肋赤藓热激蛋白60基因全长1841bp,开放阅读框1581bp,编码526个氨基酸残基；编码蛋白含有GroEL保守域,是chaperon-like superfamily家族；亚细胞定位分析显示,编码蛋白位于内质网中；活性化位点分析表明,编码蛋白存在6类活性位点；同源性分析表明,齿肋赤藓热激蛋白60与小立碗藓预测的HSP60同源性最高,达到92％,与卷柏的HSP60次之,同源性达88.83％.研究结果为该基因的实验克隆奠定基础. |
| URL标识 | 查看原文 |
| 语种 | 中文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 |
| 源URL | [http://ir.xjlas.org/handle/365004/13792]  |
| 专题 | 新疆生态与地理研究所_研究系统_荒漠环境研究室 |
| 通讯作者 | 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,新疆乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 蔡明,高贝,张道远,等. 齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J][J]. 生物信息学,2013,11(3):216-223. |
| APA | 蔡明.,高贝.,张道远.,CAI Ming.,GAO Bei.,...&中国科学院大学,北京100049.(2013).齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J].生物信息学,11(3),216-223. |
| MLA | 蔡明,et al."齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J]".生物信息学 11.3(2013):216-223. |
入库方式： OAI收割
来源：新疆生态与地理研究所
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