西北干旱区荒漠特有植物的谱系格局及其成因--以木霸王、百花蒿和绵刺为例
文献类型:学位论文
作者 | 师小军 |
答辩日期 | 2016 |
文献子类 | 博士 |
授予单位 | 中国科学院大学 |
授予地点 | 北京 |
导师 | 张明理 |
关键词 | 中国西北干旱区 谱系地理学 木霸王 百花蒿 绵刺 |
学位专业 | 植物学 |
英文摘要 | 中国西北干旱荒漠植物区系的形成与古地中海退却、喜马拉雅及青藏高原的隆起、荒漠的形成演化及第四纪冰期等密切相关,是研究荒漠植物区系演变和分布区格局形成等生物地理理论问题和干旱区植物进化、物种形成的天然实验室,开展中亚地区荒漠代表性植物物种进化及谱系地理学研究无疑是一个非常有意义的选题。本研究选取西北干旱区荒漠植被的三个特有属类群:木霸王、绵刺和百花蒿,对其进行谱系 地理学分析并探讨其谱系格局成因。主要结论如下: 1. 木霸王的谱系地理学研究 木霸王作为一种荒漠植物,广泛分布于中国西北地区,是一个研究该区域生物地理的理想材料。本文筛选了两个cpDNA基因间隔区psbK-psbI和rpl32-trnL对木霸王的31个居群226个个体进行序列变异分析。构建了单倍型网络图、进行了分子方差分析、空间分子方差分析。中性检验和错配分析用于居群动态分析。使用生态位模型对现在和末次盛冰期木霸王的潜在分布区进行了模拟。在26个发现的单倍型当中,一个单倍型广泛分布,其他单倍型限制的分布在东部或者西部区域。发现在西部天山附近和东部贺兰山附近的居群具有较高的单倍型遗传多样性。AMOVA和SAMOVA对全部居群分析表明该物种缺乏谱系地理结构,这可能与其生物特性相关。中性检验和错配分析表明该物种过去发生区域扩张事件。比较现在和末次盛冰期的潜在分布,表明木霸王在末次盛冰期期间分布区经历了收缩和片段化。基于谱系结构、居群遗传多样性和分布区模拟结果,木霸王该物种很可能是起源东部,通过河西走廊向西传播。 2. 百花蒿的谱系地理学研究 本研究筛选了2个叶绿体基因间序列psbA-trnH和trnQ-rps16,一个核基因ITS序列对百花蒿28个居群进行了序列变异分析。从两个cpDNA联合序列分析中检测到6个单倍型,从核基因ITS序列检测到31个核单倍型。cpDNA以及核基因遗传特征上分析结果表明:从物种水平上,百花蒿的cpDNA显示较高的遗传多样性(cpDNA: π = 0.0020, h = 0.794, HT = 0.820),核基因上显示出遗传多样性相对较高(ITS: π = 0.0040, h = 0.870, HT = 0.817)。根据cpDNA数据,百花蒿居群之间存在显著地遗传分化(cpDNA: GST = 0.976, NST = 0.986, NST > GST, P > 0.05),表明居群之间存在高的遗传分化和低水平的种子介导的基因流,但是对于cpDNA数据来说,百花蒿居群之间不存在明显的谱系地理结构,可能与单倍型H5广泛存在于三个沙漠有关。然而,根据核基因ITS数据,百花蒿居群之间的分化水平为中等水平(ITS: GST = 0.244, NST = 0.053, NST > GST, P < 0.05),表明对于核基因来说,百花蒿居群之间存在广泛花粉介导的基因流而且存在显著谱系地理结构,这可能与地理隔离导致的限制性基因流有关。百花蒿居群间遗传距离和地理距离有显著的相关性(cpDNA: r = 0.304, P < 0.05; ITS: r = 0.288, P < 0.05),表明地理隔离对居群的分化有较大影响。在居群水平上,每个居群(除YBA和YBB)仅固定一个cpDNA单倍型,核基因主导单倍型R1广泛分布于多个居群中。基于SAMOVA分析将所有叶绿体单倍型分为4组并与4个谱系分支相对应,谱系I主要位于腾格里-巴丹吉林沙漠,谱系II位于库布齐沙漠,谱系III位于毛乌素沙漠,谱系IV主要位于乌兰布和沙漠。谱系I和谱系IV在地理分布上有重合,表明可能在腾格里沙漠和乌兰布和沙漠之间存在一个谱系交汇区。因此,推测百花蒿现有的遗传结构可能是由生境片段化以及生态隔离导致基因流受限导致。根据错配分析(多峰曲线)、中性检验(Tajima’s D = 1.956, P = 0.970; Fu’s Fs = 5.793, P > 0.05)以及Mantel test的分析结果,我们认为百花蒿现存的异域分布模式可能与腾格里沙漠、乌兰布和沙漠、库不齐沙漠和毛乌素沙漠形成与演化的地质事件相关。基于叶绿体平均替换速率,我们推测四个不同谱系分支的分化时间大约在0.5-1.2Ma之间,这个时间段与现有的地质学文献关于本文涉及到沙漠的形成和演化时间相一致,而沙漠的形成与演化与青藏高原的青藏-黄河运动和第四纪气候周期波动息息相关,因此我们认为百花蒿的遗传分化受到地质运动和第四纪冰期的共同影响。基于居群的遗传多样性分布格局和每个谱系地理组的独特性,对整个分布区划分了四个进化显著单元并提出了相应的保护策略。 3. 绵刺的谱系地理学研究 本研究选取蒙古高原特有类群绵刺研究其谱系地理结构,选择两个叶绿体DNA片段trnL-trnF和psbA-trnH来研究绵刺13个居群共131个个体的序列测定。结果共检测到2个变异位点,共得到3个单倍型。H1普遍存在,占所有样本的71%,而且在简约性网络图中处于中心位置,因此推测H1可能是比较古老的单倍型。总的遗传多样性HT = 0.493,平均遗传多样性HS = 0.186,GST = 0.622,NST = 0.467,P > 0.05,无显著性,缺乏一个明显的谱系结构,可能与绵刺具有克隆的营养繁殖方式有关。将绵刺地理分布人为分为:中心组和边缘组,发现中心组居群内具有较高水平的单倍型多样性,边缘组居群内单倍型单一,符合中心-边缘假说。分子方差分析(AMOVA)结果表明,绵刺居群间遗传变异为47.1%,居群内遗传变异为52.9%,居群遗传分化系数FST为0.4710。这表明绵刺遗传变异主要来源于居群内部,但居群间也出现一定程度分化。绵刺居群间遗传距离和空间距离的Mantel test检验结果显示并没有相关性。错配分析呈单峰分布,表明绵刺居群历史上发生过居群动态扩张。根据绵刺的遗传分布格局,我们建议在绵刺的中心分布区建立保护区,有利于保护该物种的遗传多样性。 |
学科主题 | 植物学 |
语种 | 中文 |
源URL | [http://ir.xjlas.org/handle/365004/14750] ![]() |
专题 | 新疆生态与地理研究所_研究系统_荒漠环境研究室 |
作者单位 | 中科院新疆生态与地理研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 师小军. 西北干旱区荒漠特有植物的谱系格局及其成因--以木霸王、百花蒿和绵刺为例[D]. 北京. 中国科学院大学. 2016. |
入库方式: OAI收割
来源:新疆生态与地理研究所
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