中国科学院机构知识库网格
Chinese Academy of Sciences Institutional Repositories Grid
基于hzsB功能基因研究典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落结构

文献类型:期刊论文

作者刘莉莉2; 徐栎亚2; 赵雪2; 庄林杰2; 李怡潇2; 祝贵兵2
刊名环境科学学报
出版日期2017-08-16
期号12页码:4636-4645
关键词厌氧氨氧化细菌 Hzsb功能基因 湿地沉积物 群落结构 冗余分析
英文摘要采用基于厌氧氨氧化细菌功能基因hzs B(联氨合成酶关键基因)PCR扩增的高通量测序,研究了典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落结构.结果表明,沿纬度梯度分布的10个典型湿地沉积物样品的测序序列经处理后共得到190578条序列,在90%的相似度下聚类得到77个OTUs.基因丰度值显示,10个样品的基因拷贝数在5.42×10~4~4.20×10~6copies·g~(-1)之间.群落组成结果表明,在典型湿地沉积物中,序列主要隶属于‘Ca.Brocadia’(54.09%)、‘Ca.Jettenia’(30.97%)、‘Ca.Kuenenia’(6.95%)、‘Ca.Scalindua’(7.91%).相对丰度结果显示,各样点的主导菌属有差别.多样性分析(OTUs水平)表明,在本研究的湿地沉积物中,低纬度样点的多样性普遍高于高纬度样点.PCo A分析(OTUs水平)表明,各湿地样点厌氧氨氧化细菌的群落组成表现出明显的差异性.相关性分析(α=0.10)表明,在典型湿地沉积物中,厌氧氨氧化细菌的丰度与有机质、总氮、总碳、总硫呈负相关.冗余分析表明,‘Ca.Jettenia’与NH_4~+显著正相关,‘Ca.Scalindua’与盐度显著正相关,‘Ca.Kuenenia’在所有测定理化因子中与盐度的正相关性最显著.综上,针对厌氧氨氧化细菌hzs B功能基因扩增进行高通量测序较好地揭示了典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的多样性、群落组成及其与环境因子的关系.
源URL[http://ir.rcees.ac.cn/handle/311016/38087]  
专题生态环境研究中心_环境水质学国家重点实验室
作者单位1.中国科学院生态环境研究中心饮用水科学与技术重点实验室
2.华东理工大学资源与环境工程学院
3.中国建筑上海设计研究院有限公司
推荐引用方式
GB/T 7714
刘莉莉,徐栎亚,赵雪,等. 基于hzsB功能基因研究典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落结构[J]. 环境科学学报,2017(12):4636-4645.
APA 刘莉莉,徐栎亚,赵雪,庄林杰,李怡潇,&祝贵兵.(2017).基于hzsB功能基因研究典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落结构.环境科学学报(12),4636-4645.
MLA 刘莉莉,et al."基于hzsB功能基因研究典型湿地沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落结构".环境科学学报 .12(2017):4636-4645.

入库方式: OAI收割

来源:生态环境研究中心

浏览0
下载0
收藏0
其他版本

除非特别说明,本系统中所有内容都受版权保护,并保留所有权利。