基于RAD-seq技术的异型花SSR信息分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 王久利 ; 朱明星 ; 徐明行 ; 陈世龙 ; 张发起 |
| 刊名 | 植物研究
 |
| 出版日期 | 2017 |
| 英文摘要 | 用RAD-seq(restriction-site associated DNA sequencing)对异型花(Sinoswertia tetraptera(Maxiowicz)T.N.Ho,S.W.Liu&J.Q.Liu)进行简化基因组测序,并借此分析异型花的SSR(simple sequence repeats)信息。利用SR search软件甄别所得序列中的SSR,得到了双端各有至少100 bp的SSR位点5 844个,其中5 339个(91.38%)成功设计引物,而三核苷酸SSR位点最多(3 323个);在能成功设计引物的SSR位点中,重复序列长度包括17种(12~36 bp);重复序列的基序共277种,其中五核苷酸基序种类最多(106种);随机挑选10对SSR引物,用4个异型花居群的32个个体检测检测其可用性和多态性,经PCR和聚丙烯酰氨凝胶电泳检测,有4对(ST2、ST3、ST6和ST10)成功扩增并表现出多态性;经GENEPOP 4.4对4个位点分析,显示其等位基因数量均值为6,多态性较高且不连锁(P<0.01);4个位点在多数居群中偏离哈迪温伯格平衡(P |
| 源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/9878]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王久利,朱明星,徐明行,等. 基于RAD-seq技术的异型花SSR信息分析[J]. 植物研究,2017. |
| APA | 王久利,朱明星,徐明行,陈世龙,&张发起.(2017).基于RAD-seq技术的异型花SSR信息分析.植物研究. |
| MLA | 王久利,et al."基于RAD-seq技术的异型花SSR信息分析".植物研究 (2017). |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。