广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 王瑛3; 欧阳蒲月1; 刘永亮2; 严振1 |
| 刊名 | 热带作物学报
 |
| 出版日期 | 2014 |
| 卷号 | 35期号:04页码:746-752 |
| 关键词 | 广藿香 α-淀粉酶 PcAMY1基因 基因克隆 生物信息学分析 |
| 英文摘要 | 为了解广藿香对淀粉的利用,克隆了广藿香(Pogostemon cablin)的α-淀粉酶(alpha-amylase,AMY)基因,对其进行相关生物信息学分析。搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得AMY基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对AMY基因进行生物信息学分析。本研究获得的广藿香AMY基因命名为PcAMY1基因(GenBank登录号为KC862311),该基因全长1 420 bp,编码422个氨基酸。基于生物信息软件分析了PcAMY1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明,PcAMY1基因与牵牛(Ipomoea nil)的AMY序列同源性最高,与赤豆(Vigna angularis)、菜豆(haseolus vulgaris)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)等植物次之,与自然进化关系保持一致。PcAMY1基因在广藿香嫩茎、成熟茎、老茎、嫩叶、成熟叶、老叶中均有表达,但在老茎中表达量最高。成功克隆到广藿香PcAMY1基因,并对其进行相关生物信息学与基因表达分析。 |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/1427]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.广东食品药品职业学院，广东 广州 210520; 2.中国科学院武汉植物园，湖北 武汉 430075; 3.中国科学院华南植物园，广东 广州 510650 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王瑛,欧阳蒲月,刘永亮,等. 广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析[J]. 热带作物学报,2014,35(04):746-752. |
| APA | 王瑛,欧阳蒲月,刘永亮,&严振.(2014).广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析.热带作物学报,35(04),746-752. |
| MLA | 王瑛,et al."广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析".热带作物学报 35.04(2014):746-752. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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