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提取北方土壤真菌DNA的一种方法

文献类型:期刊论文

作者吴敏娜; 张惠文; 李新宇; 苏振成; 张成刚
刊名生态学杂志
出版日期2007-04-30
期号04页码:587-594
关键词真菌 中国北方 28srdna Dna提取 多样性 Pcr-dgge
英文摘要由于土壤理化性质的复杂性和真菌细胞壁结构的特殊性,从土壤样品中提取真菌基因组DNA比较困难。中国北方土壤与其它地区土壤相比有其自身的特点,因此,有必要优化一种适合于北方土壤真菌DNA提取的方法。本实验向灭菌黑土中分别投加12种在系统分类上差别较大的真菌,以传统土壤总DNA提取方法及纯菌DNA提取方法为基础,分别与蜗牛酶,纤维素酶进行组合、优化,得到7种不同的土壤真菌基因组DNA提取方法。利用真菌28SrDNA通用引物U1/U2-GCPCR-DGGE分析方法分别考察了7种不同方法所提取土壤真菌基因组DNA的多样性和代表性。结果表明:1)液氮研磨,纤维素酶、蜗牛酶和溶菌酶(浓度分别为6、3和1mg.ml-1)37℃作用60min,2%SDS于65℃裂解30min;2)-65℃~65℃冻融3次,纤维素酶、蜗牛酶和溶菌酶(浓度分别为6、3和1mg.ml-1)37℃作用180min,2%SDS于65℃裂解30min的组合具有较好的提取效果。利用后一种方法分别对3种理化性质差异较大的中国北方自然土壤样品真菌DNA进行提取并分析,表明所提取土壤基因组DNA真菌特异性PCR-DGGE图谱条带丰富,该方法可用于多种北方土壤真菌多样性研究。
语种中文
公开日期2011-05-05
源URL[http://210.72.129.5/handle/321005/52302]  
专题沈阳应用生态研究所_沈阳应用生态研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
吴敏娜,张惠文,李新宇,等. 提取北方土壤真菌DNA的一种方法[J]. 生态学杂志,2007(04):587-594.
APA 吴敏娜,张惠文,李新宇,苏振成,&张成刚.(2007).提取北方土壤真菌DNA的一种方法.生态学杂志(04),587-594.
MLA 吴敏娜,et al."提取北方土壤真菌DNA的一种方法".生态学杂志 .04(2007):587-594.

入库方式: OAI收割

来源:沈阳应用生态研究所

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