本发明涉及一种适用于长期载人任务的空间高能质子组合辐射防护结构，所涉及的结构为铝蒙皮、水箱、水、含硼聚乙烯结构板、高密度聚乙烯、GD414胶组成，第一层采用载人航天器铝蒙皮结构，第二层为水箱，第三层是吸收前两层产生次级中子和质子的含硼聚乙烯结构板，最后一层为进一步降低次级粒子在人体中产生能量沉积的聚乙烯材料；以质量屏蔽面密度为基础，构建了组合防护结构的分析模型，根据蒙特卡洛对太阳质子事件能谱的抽样分析方法，分析获得了组合辐射防护结构后的人体组织辐射剂量。采用本发明设计的组合辐射防护结构，在相同质量屏蔽面密度下，相比于单一铝防护结构，将太阳质子事件在人体组织中沉积的辐射剂量降低39%左右。