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面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究

文献类型:期刊论文

作者徐琳; 卜东波; 冯圣中; 孙凝晖; 李晓民; 谭光明; 刘新春
刊名计算机学报
出版日期2006
期号第2期页码:233—238
关键词Rna 二级结构预测 Fpga 并行 流水
英文摘要动态规划是RNA二级结构预测最主要的算法,文中提出一种对动态规划矩阵采用分块技术的细粒度并行算法,通过对数据依赖关系的分析,引入了流水的策略,提高了算法的效率.在时钟模拟器上验证了算法的正确性,获得了一系列关于并行加速比、空泡率、存储访问带宽等问题的模拟结果,确定了FPGA PE阵列设计中的基本参数,为FPGA成功实现奠定了基础.
语种中文
公开日期2010-10-22
源URL[http://ictir.ict.ac.cn/handle/311040/773]  
专题中国科学院计算技术研究所期刊论文_2006年中文
推荐引用方式
GB/T 7714
徐琳,卜东波,冯圣中,等. 面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究[J]. 计算机学报,2006(第2期):233—238.
APA 徐琳.,卜东波.,冯圣中.,孙凝晖.,李晓民.,...&刘新春.(2006).面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究.计算机学报(第2期),233—238.
MLA 徐琳,et al."面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究".计算机学报 .第2期(2006):233—238.

入库方式: OAI收割

来源:计算技术研究所

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