面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究
文献类型:期刊论文
作者 | 徐琳; 卜东波; 冯圣中; 孙凝晖; 李晓民; 谭光明; 刘新春 |
刊名 | 计算机学报
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出版日期 | 2006 |
期号 | 第2期页码:233—238 |
关键词 | Rna 二级结构预测 Fpga 并行 流水 |
英文摘要 | 动态规划是RNA二级结构预测最主要的算法,文中提出一种对动态规划矩阵采用分块技术的细粒度并行算法,通过对数据依赖关系的分析,引入了流水的策略,提高了算法的效率.在时钟模拟器上验证了算法的正确性,获得了一系列关于并行加速比、空泡率、存储访问带宽等问题的模拟结果,确定了FPGA PE阵列设计中的基本参数,为FPGA成功实现奠定了基础. |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2010-10-22 |
源URL | [http://ictir.ict.ac.cn/handle/311040/773] ![]() |
专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_2006年中文 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 徐琳,卜东波,冯圣中,等. 面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究[J]. 计算机学报,2006(第2期):233—238. |
APA | 徐琳.,卜东波.,冯圣中.,孙凝晖.,李晓民.,...&刘新春.(2006).面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究.计算机学报(第2期),233—238. |
MLA | 徐琳,et al."面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究".计算机学报 .第2期(2006):233—238. |
入库方式: OAI收割
来源:计算技术研究所
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