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一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现

文献类型:期刊论文

作者江先阳; 刘新春; 张佩珩
刊名计算机研究与发展
出版日期2005
期号第6期页码:930~937页
关键词全局smith-waterman算法 可重构 硬件加速卡 Fpga
英文摘要人类基因组测序工作完成后,对基因数据的处理和分析能力提出了更高的要求.生物信息学的基本研究方法之一就是计算,其算法的特点是数据量较大、算法比较简单、运算类型单一、重复性较强、潜在的并行度较高.用现有的大规模并行机或超级服务器等通用系统解决这些问题,既浪费系统的资源,使用维护也比较复杂,有些问题甚至无法在限定的时间内完成.提出了一种比较通用的算法可重构硬件加速卡的体系结构,以全局Smith-Waterman算法为例,阐述了从算法到硬件实现的映射过程,并指出了将其他类型算法映射到该加速卡上的可行性.
语种中文
公开日期2010-10-15
源URL[http://ictir.ict.ac.cn/handle/311040/648]  
专题中国科学院计算技术研究所期刊论文_2005年中文
推荐引用方式
GB/T 7714
江先阳,刘新春,张佩珩. 一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现[J]. 计算机研究与发展,2005(第6期):930~937页.
APA 江先阳,刘新春,&张佩珩.(2005).一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现.计算机研究与发展(第6期),930~937页.
MLA 江先阳,et al."一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现".计算机研究与发展 .第6期(2005):930~937页.

入库方式: OAI收割

来源:计算技术研究所

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