本发明公开一种桌面软件过滤系统，所述系统包括密码输入模块、选择模块、存储模块、隐藏处理模块和输出模块，所述密码输入模块与个人显示桌面相连，所述选择模块与个人显示桌面和存储模块相连，所述隐藏处理模块与所述存储模块、选择模块、输出模块和密码输入模块相连；所述存储模块用于存储密码参数、模式名称和操作命令；所述密码输入模块用于进行密码解锁，当用户输入的密码正确时进入个人显示桌面模式；所述选择模块用于采集用户设置的模式名称和选择的应用软件、以及用户选择对所述应用软件实施的操作命令，并将所述操作命令发送到所述隐藏处理模块；所述隐藏处理模块用于对所述应用软件进行处理操作，并通过所述输出模块输出到主屏桌面上。