三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析
文献类型:期刊论文
作者 | 李学梅 ; 余育和 ; 解绶启 ; 颜庆云 ; 陈宇航 ; 董小林 |
刊名 | 水生生物学报
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出版日期 | 2011 |
期号 | 3 |
关键词 | 斑点叉尾 银鲫 异育银鲫 PCR-DGGE 肠道微生物群落 |
ISSN号 | 1000-3207 |
中文摘要 | 以室内饲养的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究。在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少。基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在显著差异(P<0.05),而银鲫和异育银鲫之间无显著差异(P=0.383)。在斑点叉尾肠道中检测到的菌群主要是变形杆菌,包括γ-变形杆菌和α-变形杆菌;而银鲫和异育银鲫肠道中菌群主要包括梭杆菌属中的类群,还包括变形杆菌门中的气单胞菌属,以及一些未知的类群。以上结果均表明在所研究的三种鱼的幼鱼阶段,其肠道微生物组成在不同种类鱼中存在差异,且该差异受基因型的影响可能更大。 |
收录类别 | CSCD |
资助信息 | 国家重点基础研究发展计划(2007CB109205); 国家自然科学基金(30970358)资助 |
语种 | 中文 |
CSCD记录号 | CSCD:4384281 |
公开日期 | 2011-11-09 |
源URL | [http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/16029] ![]() |
专题 | 水生生物研究所_淡水生态学研究中心_期刊论文 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 李学梅,余育和,解绶启,等. 三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析[J]. 水生生物学报,2011(3). |
APA | 李学梅,余育和,解绶启,颜庆云,陈宇航,&董小林.(2011).三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析.水生生物学报(3). |
MLA | 李学梅,et al."三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析".水生生物学报 .3(2011). |
入库方式: OAI收割
来源:水生生物研究所
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