本发明公开了一种湖泊生态水位计算方法，其步骤：1：萌发期水位值计算：A、查找或建立湖泊水位‑面积；B、计算给定水位下湿生植物和挺水植物萌发区域面积；C、计算沉水植物萌发面积；D、计算水生植物萌发区面积；E、计算给定水位下湿生与挺水植物、沉水植物的覆盖度；F、按步长，计算不同水位下水生植物萌发区域总面积；G、利用水位‑植被覆盖度关系；2：幼苗生长期生态水位值计算；3：生长、扩散期生态水位值计算；4：成熟期生态水位值计算；5：种子传播期生态水位值计算；6：休眠期水位值计算；7：湖泊生态水位过程线。计算过程及参数简单，可广泛应用于亚热带地区浅水湖泊生态水位评估。