本发明公开了一种硝普钠在控制蓝藻水华中的应用，其步骤是：A、将硝普钠溶于自来水配成浓度为20mM的水溶液；B、将步骤A中配制好的硝普钠溶液以0.5%-1%的体积比均匀投加到水华蓝藻爆发的集中区域，藻类出现群体性消亡。硝普钠对水华蓝藻具有显著的杀灭作用，200μM的硝普钠溶液对中重度富营养化水体（藻密度约为1×106cells/L）的抑藻率高达80%。硝普钠释放一氧化氮是一个缓慢的过程，其控制藻类生长具有持久性。通过硝普钠缓慢分解产生一氧化氮进而引起藻类的死亡，控制了藻类水华发展和恶化。硝普钠具有抑制率高的优点，硝普钠已经在医学领域有大量用途，如用作医用注射药，对其它水生生物无毒性。