人胸腺细胞核蛋白1的DUF55结构域的结构功能及孪晶结构解析方法研究
文献类型：学位论文
| 作者 | 郁峰 |
| 学位类别 | 博士 |
| 答辩日期 | 2009-05-21 |
| 授予单位 | 中国科学院上海应用物理研究所 |
| 授予地点 | 上海应用物理研究所 |
| 导师 | 何建华 |
| 关键词 | 胸腺细胞核蛋白1 DUF55结构域 四欠面孪晶 YTH结构域 |
| 中文摘要 | 本论文主要描述了人胸腺细胞核蛋白1的DUF55结构域蛋白的表达、纯化、结晶、结构解析以及蛋白功能的初步研究。 人胸腺细胞核蛋白1是一种与细胞凋亡相关的蛋白，其具体的生物学功能还不是很清楚。全长的人胸腺细胞核蛋白1在高浓度下不稳定不适于结构研究，DUF55结构域（55 - 221）是人胸腺细胞核蛋白1中可以在体外表达稳定，适合于结构研究的部分。DUF55结构域晶体属于三方晶系，空间群为P31，晶胞参数为a = b = 51.26，c = 122.40 Å。衍射数据的分辨率为2.3 Å。意外的是，衍射强度统计分析表明DUF55结构域晶体是欠面孪晶，且包含4个twin domain因而被称之为四欠面孪晶，twin domain所占的体积比分别为0.424，0.300，0.134，0.142。由于DUF55结构域晶体的特殊性，难以使用原有的孪晶结构解析方法解析。但通过改进原有的结构解析方法，DUF55结构域晶体结构被成功解析。不同于其它四欠面孪晶，DUF55结构域晶体中仅包含一个旋转假对称。孪晶按其特征可以分为四个大类，结构解析的方法与单晶有着很大的不同，因此本论文还详细的综述了蛋白孪晶的鉴别和结构解析方法。 使用DALI程序检索结构相似蛋白发现人YTH结构域包含蛋白2中的YTH结构域与DUF55结构域极为相似。两个结构域之间的Cα原子的均方根偏差为3.4 Å，Z-score为8.4。YTH结构域是一种潜在的RNA结合结构域，这暗示DUF55结构域可能也是一个RNA相关结构域。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2012-04-11 |
| 页码 | 139 |
| 源URL | [http://ir.sinap.ac.cn/handle/331007/7314]  |
| 专题 | 上海应用物理研究所_中科院上海应用物理研究所2004-2010年 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 郁峰. 人胸腺细胞核蛋白1的DUF55结构域的结构功能及孪晶结构解析方法研究[D]. 上海应用物理研究所. 中国科学院上海应用物理研究所. 2009. |
入库方式： OAI收割
来源：上海应用物理研究所
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