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面向分子手术的DNA单分子的纳米操纵研究

文献类型:学位论文

作者吕军鸿
学位类别博士
答辩日期2004
授予单位中国科学院上海应用物理研究所
授予地点中国科学院上海应用物理研究所
导师胡钧
关键词分子手术 原子力显微镜 DNA单分子 纳米操纵 定位拾取 测序策略
其他题名Towards molecular surgery with nano-manipulation of single DNA molecules
学位专业无机化学
中文摘要“分子手术”是通过光学、力学或酶学原理在纳米尺度和单分子水平实现对生物分子的各种人工改造。本文旨在基于原子力显微镜(AFM)对DNA分子进行精确的纳米操纵,解决“分子手术”中的若干关键技术,并探索其在生物学中的应用。解决了“分子手术台”的相关问题。在对DNA样品进行进一步纯化后,分别以对DNA吸附强度比较弱的Ni+修饰衬底和以高温钝化处理来降低APS一云母吸附力,为下文的操纵做准备。为适合DNA样品以弱吸附力沉降在表面的要求,选择作用力较小的离心法作为拉直手段,拉直了长链入DNA分子和较短pBR322片段。建立了一种从基因组DNA中纳米定位切割和分离DNA片段的技术。基于AFM的interleave扫描中的抬高模式,在成功实现了对DNA分子进行切割、局域拉伸、诱导折叠等操纵之后,调节针尖与样品之间的距离来精细地控制针尖与样品针尖的相互作用,从而实现了对DNA分子的纳米切割和拾取,并对拾取的单个DNA分子进行了单分子PCR扩增。探讨了拾取的可能机制。提出了一种有序化纳米测序的新策略。基于所发展的单分子纳米操纵技术,结合常规的凝胶测序方法,提出了可对DNA单分子进行有序化测序的方法和两种组合策略。与传统的测序方法比较,具备用时少、操作简便等优点,并且在解决序列拼接、无法克隆片段等问题上有独特的优势。
语种中文
公开日期2012-04-11
页码98
源URL[http://ir.sinap.ac.cn/handle/331007/7385]  
专题上海应用物理研究所_中科院上海应用物理研究所2004-2010年
推荐引用方式
GB/T 7714
吕军鸿. 面向分子手术的DNA单分子的纳米操纵研究[D]. 中国科学院上海应用物理研究所. 中国科学院上海应用物理研究所. 2004.

入库方式: OAI收割

来源:上海应用物理研究所

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