基于单分子操纵的有序化测序策略研究
文献类型：学位论文
| 作者 | 王国华 |
| 学位类别 | 硕士 |
| 答辩日期 | 2004 |
| 授予单位 | 中国科学院上海应用物理研究所 |
| 授予地点 | 中国科学院上海应用物理研究所 |
| 导师 | 胡钧 |
| 关键词 | 基因组测序策略 有序化测序 单分子PCR反应 |
| 其他题名 | Ordered Sequencing Strategy Based on the Single Molecule Manipulation Technology |
| 学位专业 | 核技术及应用 |
| 中文摘要 | 随着DNA测序技术的发展和测序策略的完善，大规模基因组测序已不再是人们的梦想。目前的基因组测序策略大都建立在上世纪80年代美国科学家Sanger发明的鸟枪法基础之上，鸟枪法的随机性使它们都不可避免地带有测序冗余度高，片段拼接困难等症结。本研究提出一种基于单分子操纵技术的新型测序策略：有序化基因组测序策略。本策略彻底消除了Sanger的化学方法带来的随机性。首先将单个靶DNA序列拉直进行有序切割，再对每个片段分别进行PCR扩增并测序得到片段信息，之后将所有片段顺序组合，最终还原出整个目标基因组的一致序列。有序化测序使得后期的片段拼装工作高度简化，工作量随之大大降低。在整个测序过程中，单分子定位切割拾取技术以及单分子PC（Polymerase Cycle Reaction）技术都是其中非常关键的步骤，因此本研究同时也对单分子PCR反应的产物错误率以及扩增效率进行了计算及讨论。通过计算单分子PCR产物错误率，我们发现只要很好地控制反应条件，它的数值是在一个可以接受的范围之内，能够保证侧序的成功；而单分子PCR扩增效率我们认为它很可能要高于常规PCR的扩增效率，这一点还需要实验的进一步验证。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2012-04-11 |
| 页码 | 51 |
| 源URL | [http://ir.sinap.ac.cn/handle/331007/7394]  |
| 专题 | 上海应用物理研究所_中科院上海应用物理研究所2004-2010年 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王国华. 基于单分子操纵的有序化测序策略研究[D]. 中国科学院上海应用物理研究所. 中国科学院上海应用物理研究所. 2004. |
入库方式： OAI收割
来源：上海应用物理研究所
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