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一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析

文献类型:期刊论文

作者华绍烽
刊名微生物学报
出版日期2009
卷号49期号:3页码:294-301
关键词甲烷氧化菌 甲烷单加氧酶 基因测序 16S rDNA 进化分析 methanotroph soluble methane monooxygenases gene sequence phylogenetic analysis
ISSN号0001-6209
中文摘要【目的】利用分子生物学方法对一株甲烷氧化菌Methylosinus trichosporium IMV3011中的16S rDNA和溶解性甲烷单加氧酶基因序列进行分析并探索其进化分类地位。【方法】利用基因数据库已有的基因序列信息,设计PCR扩增引物和基因测序引物,对溶解性甲烷单加氧酶基因和16S rDNA进行扩增和测序,并进行溶解性甲烷单加氧酶的6个基因和氨基酸序列与同类菌株的相应序列进行联配分析。【结果】获得了全长为5319bp甲烷单加氧酶基因序列和长度为1290bp的16S rDNA序列。该菌株与Methylosinus trichosporium OB3b中相对应基因的同一性是99.0%~82.7%,MMOX氨基酸序列的同一性为99.4%~81.8%,相似性为99.8%~89.2%。基于以上分析表明MMOX组分有很高的序列保守性,特别是在活性中心区域。【结论】菌株IMV3011属于甲基弯菌属,最近似的菌株是Methylosinus trichosporium OB3b。
学科主题物理化学
收录类别CSCD
资助信息国家自然科学基金(20573124;20873167)
语种中文
CSCD记录号CSCD:3611889
公开日期2012-09-21
源URL[http://210.77.64.217/handle/362003/639]  
专题兰州化学物理研究所_OSSO国家重点实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
华绍烽. 一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析[J]. 微生物学报,2009,49(3):294-301.
APA 华绍烽.(2009).一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析.微生物学报,49(3),294-301.
MLA 华绍烽."一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析".微生物学报 49.3(2009):294-301.

入库方式: OAI收割

来源:兰州化学物理研究所

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