一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析
文献类型:期刊论文
作者 | 华绍烽![]() |
刊名 | 微生物学报
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出版日期 | 2009 |
卷号 | 49期号:3页码:294-301 |
关键词 | 甲烷氧化菌 甲烷单加氧酶 基因测序 16S rDNA 进化分析 methanotroph soluble methane monooxygenases gene sequence phylogenetic analysis |
ISSN号 | 0001-6209 |
中文摘要 | 【目的】利用分子生物学方法对一株甲烷氧化菌Methylosinus trichosporium IMV3011中的16S rDNA和溶解性甲烷单加氧酶基因序列进行分析并探索其进化分类地位。【方法】利用基因数据库已有的基因序列信息,设计PCR扩增引物和基因测序引物,对溶解性甲烷单加氧酶基因和16S rDNA进行扩增和测序,并进行溶解性甲烷单加氧酶的6个基因和氨基酸序列与同类菌株的相应序列进行联配分析。【结果】获得了全长为5319bp甲烷单加氧酶基因序列和长度为1290bp的16S rDNA序列。该菌株与Methylosinus trichosporium OB3b中相对应基因的同一性是99.0%~82.7%,MMOX氨基酸序列的同一性为99.4%~81.8%,相似性为99.8%~89.2%。基于以上分析表明MMOX组分有很高的序列保守性,特别是在活性中心区域。【结论】菌株IMV3011属于甲基弯菌属,最近似的菌株是Methylosinus trichosporium OB3b。 |
学科主题 | 物理化学 |
收录类别 | CSCD |
资助信息 | 国家自然科学基金(20573124;20873167) |
语种 | 中文 |
CSCD记录号 | CSCD:3611889 |
公开日期 | 2012-09-21 |
源URL | [http://210.77.64.217/handle/362003/639] ![]() |
专题 | 兰州化学物理研究所_OSSO国家重点实验室 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 华绍烽. 一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析[J]. 微生物学报,2009,49(3):294-301. |
APA | 华绍烽.(2009).一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析.微生物学报,49(3),294-301. |
MLA | 华绍烽."一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析".微生物学报 49.3(2009):294-301. |
入库方式: OAI收割
来源:兰州化学物理研究所
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