基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现
文献类型：期刊论文
| 作者 | 费辉 ; 张云泉 ; 王靖 |
| 刊名 | 计算机科学
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| 出版日期 | 2012 |
| 卷号 | 39期号:6页码:285-288 |
| ISSN号 | 1002-137X |
| 关键词 | QuantWiz GPU Label-free quantification Proteome QuantWiz GPU Parallel computing |
| 其他题名 | parallelization of label-free protein quantification software quantwiz based on gpu |
| 中文摘要 | QuantWiz是一款基于质谱的非标记定量软件,可很好地应用于定量蛋白质组学。实验数据的日益增大,使定量的计算量巨大,耗费时间长。GPU以几百GFlops甚至上TFlops的运算能力,为定量蛋白质组学这样的计算密集型应用提供了良好的加速方案。对QuantWiz软件做了深入的研究与分析,找到了软件性能的热点模块所在,提出了该软件在GPU上的加速方案———GPU-QuantWiz,并进行了实现。性能测试显示,在Tesla C1060上,该方案的平均加速比达到9.66倍,得到了良好的加速效果。同时,该方案还可以扩展到两块及以上的GPU上,具有良好的可扩展性。 |
| 学科主题 | Computer Science (provided by Thomson Reuters) |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2012-11-12 |
| 源URL | [http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/14682]  |
| 专题 | 软件研究所_并行计算实验室 _期刊论文 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 费辉,张云泉,王靖. 基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现[J]. 计算机科学,2012,39(6):285-288. |
| APA | 费辉,张云泉,&王靖.(2012).基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现.计算机科学,39(6),285-288. |
| MLA | 费辉,et al."基于GPU的非标记定量软件QuantWiz并行化实现".计算机科学 39.6(2012):285-288. |
入库方式： OAI收割
来源：软件研究所
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