盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析
文献类型:期刊论文
作者 | 轩春雷; 肖向文; 李晓波; 祝建波 |
刊名 | 生物技术通报
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出版日期 | 2010 |
期号 | 11页码:108-114 |
关键词 | 转录因子 表达序列标签 生物信息学 ICE1 |
ISSN号 | 1002-5464 |
其他题名 | cloning and bioinformatics analysis of a transcription factor ice1 from thellungiella halophila |
中文摘要 | ICE1基因编码一个MYB类型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,在冷胁迫条件下调节CBF基因的表达,能够提高植物抗寒性。利用盐芥5′EST序列和拟南芥ICE13′UTR保守序列设计引物,从盐芥基因组中克隆得到了1个2525bp的基因xhICE。生物信息学分析,表明该基因具有4个外显子,4个内含子,外显子/内含子边界符合经典的GT-AG规则。由此推导的cDNA包含一个1500bp的开放阅读框,编码500个氨基酸。与拟南芥ICE1相比,二者的内含子具有相同的类型和相对保守的位置,在核酸水平与氨基酸水平高度同源,并且具有相同的bHLH结构域。以上分析都表明,xhICE基因可能是盐芥ICE1基因,涉及抗寒相关的CBF转录调控途径。 |
公开日期 | 2012-11-29 |
源URL | [http://ir.xjipc.cas.cn/handle/365002/1751] ![]() |
专题 | 新疆理化技术研究所_资源化学研究室 |
作者单位 | 石河子大学生命科学学院;中国科学院新疆理化技术研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 轩春雷,肖向文,李晓波,等. 盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析[J]. 生物技术通报,2010(11):108-114. |
APA | 轩春雷,肖向文,李晓波,&祝建波.(2010).盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析.生物技术通报(11),108-114. |
MLA | 轩春雷,et al."盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析".生物技术通报 .11(2010):108-114. |
入库方式: OAI收割
来源:新疆理化技术研究所
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