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胡杨Na+/H+逆向转运蛋白基因的克隆及功能研究

文献类型:学位论文

作者吴雨霞
学位类别博士
答辩日期2006-11-07
授予单位中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
授予地点寒区旱区环境与工程研究所
导师张立新
关键词基因克隆 Na+/H+逆向转运蛋白基因 胡杨 RACE 耐盐
学位专业自然地理学
中文摘要本文以耐盐性较强的胡杨(Populus euphratica)为试材,根据植物中Na+/H+ 逆向运转蛋白基因的保守区域设计简并引物,采用RT-PCR与RACE法,对胡杨Na+/H+逆向运转蛋白进行基因克隆、序列比较、功能鉴定和表达分析, 并对其耐盐性关系进行了初步研究, 主要结果如下: 从胡杨中克隆到一条长为3665 bp的cDNA序列,该基因含有一个54 bp 的 5′ 非编码区、长为3438bp的开放阅读框,和一个173 bp的3′ 非编码区,编码一个1146个氨基酸的多肽,推测其分子量为127 kDa。将所得序列在GenBank中进行同源性比较,结果表明该基因属于Na+/H+逆向运转蛋白基因家族,而且与拟南芥的基因具有极高的同源性,将该基因命名为PeSOS1(GenBank Acc. No. DQ517530)。用TMPRED软件分析表明,PeSOS1蛋白N端有12个可能的跨膜区段。这与拟南芥质膜型Na+/H+逆向转运蛋白SOS1 N端有12个跨膜区一致。 运用ClustalW软件对PeSOS1进行序列比对,发现该基因的核苷酸序列及其推导出的氨基酸序列与其它植物的Na+/H+逆向转运蛋白基因有一定的相似性,同源序列比较发现,胡杨Na+/H+逆向运转蛋白与已知的其它质膜型Na+/H+逆向转运蛋白也有较高的同源性:与拟南芥、水稻、小麦的质膜Na+/H+逆向运转体序列同源性分别为 63.35%, 61.21% 和 60.74%,而与酵母、野滨藜和拟南芥液泡型Na+/H+逆向运转体的序列同源性很低,分别约为19.4%,19.0%和17.7%。系统发育分析也表明 PeSOS1与拟南芥、水稻、小麦和酵母质膜型 Na+/H+逆向运转体的亲缘关系很近,与液泡型的Na+/H+逆向转运蛋白亲缘关系较远。因此推断所获得的全长cDNA 的编码产物可能是质膜型 Na+/H+逆向运转体。 将PeSOS1转入大肠杆菌突变体EP432(EcNhaA 和 EcNhaB均缺失)菌株,结果表明PeSOS1可显著恢复突变菌株对高盐的敏感性,与阴性对照相比,在200 mmol/L NaCl胁迫下,转基因细菌中Na+离子含量有所降低,K+含量明显增加,K+/Na+增加较多。说明PeSOS1基因具有与大肠杆菌Na+/H+ 逆向转运蛋白(EcNhaA 及 EcNhaB)基因相似的功能。 半定量RT-PCR分析结果表明,在200 mM NaCl处理下,PeSOS1的转录水平迅速增加,2小时之后达到较高的水平,4小时之后达到最高值,并且在24小时的处理时间内一直维持在很高的水平。 从PeSOS1中选取3′ 端大约510 bp 的亲水区域构建原核表达载体 pET-Pe510,并在大肠杆菌 BL21(DE3)中表达融合蛋白,亲和层析纯化以后,溶于PBS中获得抗原,免疫兔子制备PeSOS1抗体。 采用制备的抗体进行Western-blotting分析表明 PeSOS1的表达在胡杨根200 mM NaCl 处理下与诱导的时间成正比;在叶中,在没有用200 mM NaCl处理的PeSOS1 蛋白基因有一定的微量表达,而用 NaCl 处理 12 h、24 h和 48 h的胡杨,PeSOS1基因的表达显著增加;在胡杨茎中200 mM NaCl 处理下PeSOS1基因有微量表达。表明PeSOS1基因是一个诱导表达型基因,并且其表达具有组织特异性。这与其它的 Na+/H+逆向转运蛋白基因有相似的结果。 PeSOS1基因的克隆及功能研究为进一步利用Na+/H+逆向转运蛋白基因开展植物耐盐性研究提供了基础。
语种中文
公开日期2013-08-22
页码112
源URL[http://ir.casnw.net/handle/362004/21555]  
专题寒区旱区环境与工程研究所_研究生学位论文_学位论文
推荐引用方式
GB/T 7714
吴雨霞. 胡杨Na+/H+逆向转运蛋白基因的克隆及功能研究[D]. 寒区旱区环境与工程研究所. 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所. 2006.

入库方式: OAI收割

来源:寒区旱区环境与工程研究所

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