基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建
文献类型：期刊论文
| 作者 | 唐源江2; 曹雯静2; 吴坤林1 |
| 刊名 | 中国农业科学
 |
| 出版日期 | 2015 |
| 卷号 | 48期号:09页码:1795-1806 |
| 关键词 | 国兰 种质资源 遗传多样性 SRAP标记 分子身份证 |
| 英文摘要 | 【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平,并构建分子指纹图谱及分子身份证,为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑,也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物,每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选;PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳胶图进行人工读带,并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数,并进行遗传多样性分析。用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析,并计算遗传相似性系数。采用引物对组合的方法,构建139份国兰种质资源数字指纹图谱。【结果】从208对SRAP引物中共筛选出17对多态性好且重复性高的引物,对供试材料进行PCR扩增,共扩增出DNA条带489条,其中多态性谱带484条,多态性比率(PPB)为98.89%,观测等位基因数平均值为2.00,多态性信息含量平均值为0.94,每个位点的有效等位基因数平均值为1.49,Nei’s基因多样多样性指数平均值为0.30,Shannon信息指数平均值为0.45。UPGMA聚类分析表明,139份国兰种质资源的遗传相似系数变化范围为0.51—0.91。在相似系数为0.70时,可划分为6个类群。用SRAP多种引物组合方法可有效区分所有材料,并构建出139份国兰种质资源特异性分子身份证,置信概率达到99.99%。根据聚类结果可以将国兰种质分为4组:一为春兰组,由春兰种质单独构成;二为建墨兰组,主要由建兰和墨兰种质组成;三为寒蕙兰组,主要由寒兰、蕙兰和杂交系组成;四为剑莲兰组,由春剑和莲瓣兰种质组成。而四组之间剑莲兰组与寒蕙兰组亲缘关系最近,与建墨兰组次之,与春兰组亲缘关系较远。【结论】所试国兰种质具有较丰富的遗传多样性水平,基于17对SRAP引物组合所构建的139份国兰种质的分子身份识别体系具有唯一性和高效性,SRAP标记是在分子水平鉴定国兰种质的有效方法之一。 |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/2835]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.中国科学院华南植物园,广州 510650 2.华侨大学花卉工程研究所,福建厦门 361021; |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 唐源江,曹雯静,吴坤林. 基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建[J]. 中国农业科学,2015,48(09):1795-1806. |
| APA | 唐源江,曹雯静,&吴坤林.(2015).基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建.中国农业科学,48(09),1795-1806. |
| MLA | 唐源江,et al."基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建".中国农业科学 48.09(2015):1795-1806. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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