基于全基因组关联研究数据二次分析的肿瘤候选基因变异研究
文献类型：项目
| 项目编号 | 81101545 |
| 作者 | 张昆林
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| 文献子类 | 青年科学基金项目 |
| 英文摘要 | 肿瘤的发生是由遗传因素和环境因素共同作用导致的，且遗传因素往往具有多基因遗传的特征。不同肿瘤的全基因组关联研究（GWAS）表明这些肿瘤的遗传（germline）易感性常见变异（common variant）通常是低外显率的，这些低外显率常见变异的组合效应的揭示对研究肿瘤相关的机理起到重要作用。然而，标准的GWAS数据分析方法并不能检测这种常见变异的组合效应。本研究中，我们将在前期研究工作基础上设计开发新的基于通路的分析方法（pathway-based analysis,PBA），对公开的常见多基因遗传的肿瘤的GWAS数据进行二次深入分析，检测与特定肿瘤相关的通路即候选基因变异的组合效应；并通过网络分析等方法，比较不同肿瘤在关联通路及关联基因变异上的异同；最后以研究结果为依据建立相应的数据库。本研究在基因组学水平上探究肿瘤病因，为肿瘤的实验研究和临床诊断提供依据。 |
| 发表日期 | 2011-12-31 |
| 结束日期 | 2014-12-30 |
| 关键词 | 全基因组关联研究 肿瘤 通路 基于通路的分析 |
| 项目经费 | 22 |
| URL标识 | 查看原文 |
| 源URL | [http://ir.psych.ac.cn/handle/311026/30271]  |
| 专题 | 心理研究所_健康与遗传心理学研究室 |
| 作者单位 | 中国科学院心理研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张昆林.基于全基因组关联研究数据二次分析的肿瘤候选基因变异研究.2011. |
入库方式： OAI收割
来源：心理研究所
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