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阴离子——阴离子型卤键作用的理论研究

文献类型:会议论文

作者王桂敏; 陈照强2; 徐志建2; 王进安; 杨洋1; 蔡婷婷2; 施继烨; 朱维良2
出版日期2016-07-01
关键词卤键 阴离子 量子力学/分子力学 药物设计
页码1
英文摘要卤键是卤素原子的σ-空穴(σ-hole)与亲核试剂之间形成的非共价相互作用。在生理条件下,药物分子可能呈现出不同的质子化状态。含卤小分子去质子化后,卤素头部正电性的σ-空穴会消失,可能与同样带负电荷的亲核分子相互排斥。经过数据库搜寻,我们发现带负电荷的分子之间存在具有卤键几何特征的作用模式。基于对卤苯甲酸和丙炔酸的复合物的量化计算表明阴离子-阴离子型卤键在真空中是不稳定的,而在溶剂中可以稳定存在。卤键作用距离和能量均说明阴离子-阴离子型卤键较中性分子间的卤键更强,自然键轨道(NBO)和分子中的原子的量化理论(QTAIM)的分析同样证实了上述结论。运用对称性匹配微扰理论(SAPT)进行能量分解后,我们发现诱导作用对分子间的相互吸引贡献很大。我们从蛋白晶体数据库(PDB)中选取了4个蛋白-配体复合物,利用量子力学/分子力学杂交方法进行了计算,结果提示阴离子-阴离子型卤键可以提高配体的亲和力,最大作用能接近3kcal/mol。
会议录中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
文献子类Article
语种中文
源URL[http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/267033]  
专题药物发现与设计中心
上海药物代谢研究中心
作者单位1.中国科学院上海药物研究所,上海药物代谢研究中心,上海 201203, 中国.
2.中国科学院上海药物研究所,药物发现与设计中心,上海 201203, 中国.;
推荐引用方式
GB/T 7714
王桂敏,陈照强,徐志建,等. 阴离子——阴离子型卤键作用的理论研究[C]. 见:.

入库方式: OAI收割

来源:上海药物研究所

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