阴离子——阴离子型卤键作用的理论研究
文献类型:会议论文
作者 | 王桂敏; 陈照强2; 徐志建2![]() ![]() |
出版日期 | 2016-07-01 |
关键词 | 卤键 阴离子 量子力学/分子力学 药物设计 |
页码 | 1 |
英文摘要 | 卤键是卤素原子的σ-空穴(σ-hole)与亲核试剂之间形成的非共价相互作用。在生理条件下,药物分子可能呈现出不同的质子化状态。含卤小分子去质子化后,卤素头部正电性的σ-空穴会消失,可能与同样带负电荷的亲核分子相互排斥。经过数据库搜寻,我们发现带负电荷的分子之间存在具有卤键几何特征的作用模式。基于对卤苯甲酸和丙炔酸的复合物的量化计算表明阴离子-阴离子型卤键在真空中是不稳定的,而在溶剂中可以稳定存在。卤键作用距离和能量均说明阴离子-阴离子型卤键较中性分子间的卤键更强,自然键轨道(NBO)和分子中的原子的量化理论(QTAIM)的分析同样证实了上述结论。运用对称性匹配微扰理论(SAPT)进行能量分解后,我们发现诱导作用对分子间的相互吸引贡献很大。我们从蛋白晶体数据库(PDB)中选取了4个蛋白-配体复合物,利用量子力学/分子力学杂交方法进行了计算,结果提示阴离子-阴离子型卤键可以提高配体的亲和力,最大作用能接近3kcal/mol。 |
会议录 | 中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
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文献子类 | Article |
语种 | 中文 |
源URL | [http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/267033] ![]() |
专题 | 药物发现与设计中心 上海药物代谢研究中心 |
作者单位 | 1.中国科学院上海药物研究所,上海药物代谢研究中心,上海 201203, 中国. 2.中国科学院上海药物研究所,药物发现与设计中心,上海 201203, 中国.; |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 王桂敏,陈照强,徐志建,等. 阴离子——阴离子型卤键作用的理论研究[C]. 见:. |
入库方式: OAI收割
来源:上海药物研究所
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