HIV-1蛋白酶构象变化机制及抗药性突变的影响
文献类型：会议论文
| 作者 | 于玉琪; 王进安; 陈照强; 王桂敏; 邵强 ; 施继晔; 朱维良
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| 出版日期 | 2016-07-01 |
| 关键词 | HIV-1蛋白酶 显/隐性混合溶剂模型副本交换 抗药性 |
| 页码 | 1 |
| 英文摘要 | HIV-1蛋白酶是一个重要的药物靶标。蛋白酶从闭合到张开的构象变化主要集中于flap区域,其动态变化对底物结合至关重要。采用显/隐性混合溶剂模型副本交换方法(hREMD)[1],我们成功捕捉到已解析晶体结构中的闭合和半张开状态,还发现了一个介于闭合和半张开状态的中间态:curled状态。通过绘制蛋白酶构象变化的自由能图景,我们描绘了蛋白酶完整的构象变化过程:闭合→curled→半张开→全张开。与此同时,为了研究抗药性突变对蛋白酶及蛋白酶-抑制剂复合物结构柔性的影响,我们用常规的动力学模拟研究了野生型蛋白酶及Flap~+(L10I/G48V/I54V/V82A)、Act(V82T/I84V)两个突变体及他们分别与Amprenavi r和Darunavir两种抑制剂的复合物~([2])。对比发现蛋白酶的80s(80's)loop与flap区域存在强疏水作用稳定flap的闭合状态,Act突变减弱了疏水作用,从而导致蛋白酶的flap区域更容易过渡到半张开构象。对应的,Act突变的蛋白酶-抑制剂复合物内,抑制剂疏水团与flap区域的I50(I50')和80s(80's)loop区域的I84(I84')、V82(V82')疏水簇作用减弱,使flap区域柔性增大,从而赋予其更强抗药性[3]。 |
| 会议录 | 中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会：化学信息学与化学计量学
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| 文献子类 | Article |
| 语种 | 中文 |
| 源URL | [http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/267034]  |
| 专题 | 药物发现与设计中心 |
| 作者单位 | 中国科学院上海药物研究所,药物发现与设计中心,上海 201203, 中国. |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 于玉琪,王进安,陈照强,等. HIV-1蛋白酶构象变化机制及抗药性突变的影响[C]. 见:. |
入库方式： OAI收割
来源：上海药物研究所
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