HIV-共受体CCR5的三维结构及与其拮抗剂TAK 779相互作用的比较分子模拟(英文)
文献类型:期刊论文
作者 | 黄小琴; 蒋华良![]() ![]() ![]() |
刊名 | Acta Pharmacologica Sinica
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出版日期 | 2000-06-15 |
期号 | 06页码:8 |
关键词 | TAK 779 CCR5受体 分子结构 HIV-1 计算机辅助设计 |
文献子类 | Article |
英文摘要 | 目的:研究HIV-1的共受体CCR5与其拮抗剂TAK779的相互作用机制。方法:用比较分子模拟方法建立CCR5受体的三维结构模型;通过量子化学计算得到TAK779分子的结构参数和最优几何构型;用DOCK4.0程序将TAJ779分子对接到CCR5受体的结合位点上。结果:通过分子力学优化得到了CCR5受体的三维结构模型,配体的结合口袋位于第三、五、六、七跨膜区,组成结合口袋的氨基酸残基主要为Thr105、Leu107、Tyr108、Gly111、Phe112、Ser114、Gly115、Lys197、Glu283、Gly286、Met287、Cys290;TAK779与CCR5受体的相互作用方式为氢键、静电和疏水作用;配体与受体的结合能为-51.606 kcal/mol。结论:上述模型有助于进一步理解膜受体识别HIV-1病毒的分子机制并设计新的HIV-1抑制剂。 |
资助项目 | Project the Key Program of National Natural Science Foundation of China[29790123] ; Project the Key Program of National Natural Science Foundation of China[29725203] |
语种 | 英语 |
源URL | [http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/270384] ![]() |
专题 | 药物发现与设计中心 |
作者单位 | 中国科学院上海药物研究所,药物发现与设计中心,上海 201203, 中国. |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 黄小琴,蒋华良,罗小民,等. HIV-共受体CCR5的三维结构及与其拮抗剂TAK 779相互作用的比较分子模拟(英文)[J]. Acta Pharmacologica Sinica,2000(06):8. |
APA | 黄小琴.,蒋华良.,罗小民.,陈凯先.,嵇汝运.,...&裴钢.(2000).HIV-共受体CCR5的三维结构及与其拮抗剂TAK 779相互作用的比较分子模拟(英文).Acta Pharmacologica Sinica(06),8. |
MLA | 黄小琴,et al."HIV-共受体CCR5的三维结构及与其拮抗剂TAK 779相互作用的比较分子模拟(英文)".Acta Pharmacologica Sinica .06(2000):8. |
入库方式: OAI收割
来源:上海药物研究所
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