对虾是世界重要的海水养殖动物，其良种选育是产业发展的基石。在过去三十年，基于数量遗传学的选育方法，对虾重要经济性状的遗传改良取得显著成效。前期的选育研究较多集中在生长性状，对于遗传力较低的抗性性状研究较少。近年来，世界对虾产业因急性肝胰腺坏死综合征（Acute hepatopancreas necrosis disease，AHPND）的爆发遭受了严重的打击。AHPND主要是由携带pVA1质粒的副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）感染引起，选育抗副溶血弧菌的对虾种质被认为是解决AHPND的根本途径。由于对抗病性状的遗传评估准确率较低以及表型难以度量等问题，利用传统育种技术进行抗病性状的选育效率较低。随着基因分型技术的发展，分子育种技术日渐成熟，将传统选育技术与分子育种技术结合，对加快对虾抗弧菌性状的遗传改良具有重要意义。本论文以凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）为实验对象，分别从标准化抗弧菌性状测试方法的建立、对虾抗弧菌表型组研究、抗性机理解析和抗性相关分子标记筛选等方面开展了系统研究，为对虾的抗病育种和病害防治提供了重要理论依据和技术支撑。研究取得的主要进展如下：

1.建立了对虾抗副溶血弧菌标准化测试方法。研究了不同培养条件下副溶血弧菌的生长规律和生长特点，建立了用于对虾抗性测试的副溶血弧菌规模化培养方法；比较了处于不同生长时期的副溶血弧菌对凡纳滨对虾幼虾的感染能力，证实处于平台期前期的副溶血弧菌更适合感染实验。通过改进副溶血弧菌培养方式，优化感染方法，使对虾抗弧菌性状测试标准化。

2．开展了对虾抗副溶血弧菌感染的表型组研究。针对凡纳滨对虾的AHPND病理特征，研究了副溶血弧菌感染对虾的主要靶组织——肝胰腺的颜色变化与病原菌载量的关系，并将弧菌感染对虾的进程划分为四个等级。肝胰腺颜色变化和副溶血弧菌载量可被开发为对虾对弧菌抗性的表型参数，为家系或群体的抗病能力测定提供新的表型指标。

3．建立了对虾体内副溶血弧菌载量的定量检测方法，比较了对虾抗性和敏感家系在弧菌感染过程中体内副溶血弧菌的动态变化规律。首先根据副溶血弧菌毒力因子序列设计引物和探针，经过引物筛选、体系优化，建立了用于检测带毒素质粒的副溶血弧菌的TaqMan探针荧光定量PCR技术，使检测的灵敏度和准确性明显提高。比较了对虾的抗性家系和敏感家系在弧菌浸泡感染后体内副溶血弧菌的动态变化特征，结果表明抗性家系体内副溶血弧菌的载量显著低于敏感家系，提示抗性家系可能通过抑制副溶血弧菌在体内的增殖从而减少对机体的影响，这为进一步解析抗性机制奠定了基础。

4．开展对虾抗性家系和敏感家系的比较转录组研究。以课题组长期选育的材料为基础，结合近两年副溶血弧菌感染测试的家系数据和系谱关系，对抗性家系和敏感家系进行了转录组测序，筛选获得392个差异表达基因。其中，表皮蛋白（Flexible cuticle protein）和肌球蛋白（Myosin）基因在抗性家系中的表达量较高，而与代谢和免疫相关的基因在敏感家系中表达量较高。这些差异基因的表达水平可能与对虾家系的抗病能力强弱有关，可为对虾抗性家系的选育提供重要参考。

5．通过关联分析技术筛选鉴定了与对虾抗副溶血弧菌性状相关的SNP标记和候选基因。通过对对虾的敏感材料和抗性材料进行目标区域测序，分析了1,566个SNPs的不同等位基因在易感材料和抗性材料中的频率，通过关联分析获得30个与对虾抗弧菌性状相关的SNPs，并利用候选基因关联分析方法，在LvALF6基因上筛选获得6个与抗弧菌性状相关的SNPs，为对虾抗病育种提供了重要的分子标记和候选基因。