猕猴桃EPIC标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘磊1,3; 姚小洪1; 黄宏文2 |
| 刊名 | 园艺学报
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| 出版日期 | 2013 |
| 卷号 | 40期号:06页码:1162-1168 |
| 关键词 | 猕猴桃属 EPIC标记 跨种扩增 系统发育 |
| 英文摘要 | 采用生物信息学方法通过比较ESTs数据和基因组数据开发了猕猴桃的双亲遗传单拷贝的EPIC标记以用于猕猴桃属植物系统发育研究。通过比较中华猕猴桃(Actinidia chinensis)和美味猕猴桃(A.deliciosa)的ESTs数据和葡萄(Vitis vinifera)基因组数据,以一致性85%为标准共检测到129个EPIC标记,并从中设计96对引物。其中21对EPIC引物在中华猕猴桃和美味猕猴桃两个商业化栽培品种中呈现稳定扩增,核酸多态性(Pi)为0.003~0.069,变异位点为0.7%~14.8%,简约性信息位点为0~9.4%。用其中的EPIC-1标记重建中华猕猴桃、美味猕猴桃、毛花猕猴桃(A.eriantha)、绵毛猕猴桃(A.fulvicoma var.lanata)和金花猕猴桃(A.chrysantha)的系统发育关系,显示其跨种间扩增的实用性并获得分辨率较高的系统发育树。本研究中开发的EPIC标记可以作为通用引物用于猕猴桃属植物系统发育分析。 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/3250]  |
| 专题 | 研究领域 中国科学院华南植物园 |
| 作者单位 | 1.中国科学院武汉植物园,中国科学院种质创新与特色农业重点实验室,武汉 430074; 2.中国科学院华南植物园,中国科学院植物资源保护及可持续利用重点实验室,广州 510650 3.中国科学院大学,北京100049; |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘磊,姚小洪,黄宏文. 猕猴桃EPIC标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用[J]. 园艺学报,2013,40(06):1162-1168. |
| APA | 刘磊,姚小洪,&黄宏文.(2013).猕猴桃EPIC标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用.园艺学报,40(06),1162-1168. |
| MLA | 刘磊,et al."猕猴桃EPIC标记开发及其在猕猴桃属植物系统发育分析中的应用".园艺学报 40.06(2013):1162-1168. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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