野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 李海2; 黄海波2; 刘鹏2; 黄松2; 张桂芳2; 张丹雁2; 张建霞3; 陈念1; 赖小平1 |
| 刊名 | 世界科学技术(中医药现代化)
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| 出版日期 | 2012 |
| 卷号 | 14期号:05页码:2044-2049 |
| 关键词 | 铁皮石斛 内转录间隔区 系统发育分析 物种鉴定 |
| 英文摘要 | 目的：测定和分析不同产地野生铁皮石斛样品的 rDNA ITS 序列，探讨利用 ITS 序列推测铁皮石斛样品产地来源的可行性。方法：提取总基因组 DNA，使用通用引物 ITS5F/ITS4R 进行 PCR 扩增，产物经电泳检测、纯化和测序后用 Sequin 11.0 提交 GenBank。用 Bioedit 7.0 中的 Clustal W 对GenBank 中包括本研究提交的 11 条在内的所有 33 条铁皮石斛的 ITS 序列进行多重序列比对，随后以金钗石斛和密花石豆兰为外群，用邻接法构建 NJ 系统发育树。结果：从所有测定的 ITS 序列中选择 11条提交 GenBank，获得登录号 JF803235~JF803245。所有铁皮石斛经比对后共发现 645 个同源位点，9个信息位点（ITS1 区 3 个，5.8 S 区 4 个，ITS2 区 2 个）。系统发育分析发现，金钗石斛和密花石豆兰位于树的基部，另外 32 条铁皮石斛共同形成单个大的分支，未发现产地来源与系统树的拓扑结构之间存在对应关系。结论：由于缺乏完善的铁皮石斛标准品及其 DNA 参考序列的提交标准，同时单个 ITS序列仅能提供有限的系统发育信息位点，因此通过 ITS 序列分析的方法推测铁皮石斛样品的产地来源目前尚不具有可行性。 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/2939]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.广州中医药大学中药学院, 广州 510006 2.广州中医药大学中药学院, 广州 510006; 3.中国科学院华南植物园, 广州 510560; |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李海,黄海波,刘鹏,等. 野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析[J]. 世界科学技术(中医药现代化),2012,14(05):2044-2049. |
| APA | 李海.,黄海波.,刘鹏.,黄松.,张桂芳.,...&赖小平.(2012).野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析.世界科学技术(中医药现代化),14(05),2044-2049. |
| MLA | 李海,et al."野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析".世界科学技术(中医药现代化) 14.05(2012):2044-2049. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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