中国板栗EST-SNP和抗栗疫病候选基因分析及同源比对
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘伟1,2; 康明1; 黄宏文1 |
| 刊名 | 植物科学学报
 |
| 出版日期 | 2012 |
| 卷号 | 30期号:01页码:55-63 |
| 关键词 | 中国板栗 栗疫病 候选基因 EST-SNP |
| 英文摘要 | 从壳斗科基因组数据库下载中国板栗的 Unigene 序列和基于这些 Unigene 序列开发获得的 EST-SNP 数据，分析发现，中国板栗 EST-SNP 的发生频率为 4 个/kb，在碱基置换类型上，C-T 置换发生的频率最高，C-G 置换发生频率最低，转换和颠换的比值为 1. 74 ∶1。对 211 个在中国板栗健康组织和感染栗疫病的染病组织中差异表达的基因进行基因注释和蛋白质结构域分析，结果表明，参与蛋白质代谢、对胁迫、生物和非生物刺激发生响应的基因所占的比例较多，并发现了大量的跨膜结构、信号肽、卷曲螺旋和蛋白激酶相关结构域。对这 211 个中国板栗抗栗疫病相关的候选基因和其 Unigene 序列进行同源比对，统计整理定位在具有同源性的 Unigene 序列上的EST-SNP，共有3023 个 EST-SNP 标记。这批 EST-SNP 标记可为今后开展基于候选基因途径的中国板栗抗栗疫病居群基因组学研究和关联作图研究奠定重要的基础。 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/3040]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.中国科学院华南植物园,中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广州 510650; 2.中国科学院研究生院,北京 100049 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘伟,康明,黄宏文. 中国板栗EST-SNP和抗栗疫病候选基因分析及同源比对[J]. 植物科学学报,2012,30(01):55-63. |
| APA | 刘伟,康明,&黄宏文.(2012).中国板栗EST-SNP和抗栗疫病候选基因分析及同源比对.植物科学学报,30(01),55-63. |
| MLA | 刘伟,et al."中国板栗EST-SNP和抗栗疫病候选基因分析及同源比对".植物科学学报 30.01(2012):55-63. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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