不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘洪伟1; 杨艳芳1; 熊王丹2; 吴平治2; 吴国江2; 邱德有1 |
| 刊名 | 植物研究
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| 出版日期 | 2016 |
| 卷号 | 36期号:04页码:605-612 |
| 关键词 | 巴豆烷 蓖麻烯合酶 生物信息学 |
| 英文摘要 | 利用Gen Bank中已登录的完整的麻风树、乳浆大戟、蓖麻和乌桕中的13个蓖麻烯合酶(Casbene synthase,CS;EC 4.6.1.7)基因序列,通过生物信息学方法对其核酸及氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质的二级结构、三级结构及功能域等进行了分析预测。结果表明,13个CS基因的ORF长度均在1 647~1 845 bp,蛋白分子量均在63.0~70.8 k D,终止密码子为TGA或TAA,理论等电点均小于7.0,表明CS蛋白呈酸性。氨基酸含量最高的均为亮氨酸。核苷酸同源性比较分析表明,CS基因主要分为两类。导肽预测发现其中6个CS具有导肽,均为叶绿体导肽。信号肽和扩模结构域预测发现这些CS不存在信号肽和跨膜结构域,肽链整体呈现为亲水性。这些CS的主要二级结构元件为α-螺旋,并且都包含两个萜类合酶功能域。以上研究为进一步探索CS基因的功能提供一定理论依据。 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/3118]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.林木遗传育种国家重点实验室,中国林业科学研究院林业研究所,北京100091; 2.中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室,广州 510650 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘洪伟,杨艳芳,熊王丹,等. 不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析[J]. 植物研究,2016,36(04):605-612. |
| APA | 刘洪伟,杨艳芳,熊王丹,吴平治,吴国江,&邱德有.(2016).不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析.植物研究,36(04),605-612. |
| MLA | 刘洪伟,et al."不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析".植物研究 36.04(2016):605-612. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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