华南植物园锥栗F-MSAP采样策略及遗传多样性分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 刘孟1; 欧阳学军1,2; 陈洁1; 全慧敏1; 叶万辉1; 刘卫1 |
| 刊名 | 广西植物
 |
| 出版日期 | 2017 |
| 卷号 | 37期号:01页码:15-21+8 |
| 关键词 | 锥栗 甲基化 F-MSAP 引物筛选 样品保存 |
| 英文摘要 | 基因组甲基化修饰受环境因素的影响。在以甲基化为代表的表观遗传学研究中,如何减少保存环境对异地采后样品的影响,提高整个实验的准确性和科学性,目前尚未有系统的认知。该研究选取5种常用的采后样品保存方式(液氮冷冻、-20℃冷冻、变色硅胶干燥、密封袋密封、75%酒精浸泡),分别用Wilcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析方法,对华南植物园锥栗进行F-MSAP研究,以期找出最佳保存方式。同时,利用正交试验法对F-MSAP体系进行优化,筛选出9对引物(E3-H/M2;E5-H/M2;E6-H/M1;E6-H/M5;E8-H/M1;E8-H/M5;E9-H/M2;E11-H/M5;E14-H/M1),并对不同发育时期的锥栗甲基化水平及遗传多样性进行了论述。结果表明:在锥栗F-MSAP的研究中,Willcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析结论一致,密封袋保存效果最佳;成熟叶半甲基化率(27.83%)和总甲基化率(51.13%)高于幼叶(21.35%,45.90%),全甲基化率(23.30%)低于幼叶(24.55%),平均多态位点百分数39.60%,香农信息指数0.207±0.002,表现出较高的甲基化水平和遗传多样性。 |
| 源URL | [http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/3123]  |
| 专题 | 研究领域 |
| 作者单位 | 1.中国科学院华南植物园,广州 510650; 2.中国科学院华南植物研究所鼎湖山树木园,广东肇庆 526070 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘孟,欧阳学军,陈洁,等. 华南植物园锥栗F-MSAP采样策略及遗传多样性分析[J]. 广西植物,2017,37(01):15-21+8. |
| APA | 刘孟,欧阳学军,陈洁,全慧敏,叶万辉,&刘卫.(2017).华南植物园锥栗F-MSAP采样策略及遗传多样性分析.广西植物,37(01),15-21+8. |
| MLA | 刘孟,et al."华南植物园锥栗F-MSAP采样策略及遗传多样性分析".广西植物 37.01(2017):15-21+8. |
入库方式： OAI收割
来源：华南植物园
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